Forskningsassistent i epigenetik och lymfombiologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 500 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.igp.uu.se

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Om oss 
Vi utlyser en tjänst som forskarassistent med inriktning epigenetik. Du kommer att arbete tillsammans med professor Ingrid Glimelius inom klinisk och tumörbiologisk cancerforskning. Vi är en grupp av c:a 10 personer (doktorander, post docs, forskare och mer seniora forskare) med olika bakgrund som jobbar med olika cancerformer där vi använder data från våra svenska kvalitetsregister och övriga nationella register. Vi studerar olika tumörer, men främst lymfom, testikelcancer och äggstockscancer. Flera av oss jobbar som läkare på onkologikliniken Akademiska sjukhuset vilket ger en klinisk förankrad forskning. Vi befinner oss i en expansiv fas och söker därför fler medarbetare som vill följa oss på vår tillväxtresa, vi arbetar i ett fält där kunskapen direkt kan appliceras till klinisk vård. Du får möjlighet att arbeta på EpiHubben som är en dynamisk och vänlig forskarmiljö med stora möjligheter till interaktion där idag ett 50 tal forskare från olika grupper arbetar. Vi säker en talangfull och motiverad forskare som har erfarenhet och kunskap om databearbetning av genetiska data och epigenetik. Laborativ erfarenhet är meriterade. Du ska kunna programmera i STAT, SAS och/eller R samt program som kan hantera genetiska data. Gruppens forskning är inriktad mot studier av lymfom, både kliniska prövningar, tumörbiologiska studier samt stora registerlänkningar. Mer information om forskargruppen finns på Ingrid Glimelius - Immunology, Genetics and Pathology, IGP - Uppsala University, Sweden (uu.se). 

Arbetsuppgifter/Projektbeskrivning: 
I tjänsten ingår att självständig utveckla och bedriva forskningsprojekt inom området lymfom. Arbetet bedrivs i huvudsak genom att använda både kliniska och tumörbiologiska data. Arbetet kommer att inriktas på ett av följande projekt; 1) studera hur genetiska och epigenetiska karakteristika ändras över tid mellan diagnostiska tumörbiopsier och uppföljande biopsier, 2) metodutveckling i detektionen av små mängder kvarvarande lymfomceller i blod och benmärg genom minimal residual disease mätningar. 3) Studera de epigenetiska karakteristika som påverkar prognos och är associerat med negativa prognostiska faktorer

Kvalifikationskrav:  
- Erfarenhet i next generation sequencing biblioteks förberedande statistik
- Experience med epigenetiska methoder som ATAC-seq, och CUT&Tag och familjär med single-cell technologier.
- Kunskap om att hantera frusna eller parafinninbäddade tumör prover 
- God förmåga till skriftligt och muntlig kommunikation av vetenskapliga resultat. 
- Genomföra statistik analys med hjälp av SAS, STATA och/eller R/Python som statistiska program. 
- Mycket god förmåga till vetenskapligt skrivande på Engelska.  
- Noggrann, professionell och välorganiserad 
- Kunskap inom medicin, med ett specifikt fokus på onkologi, hematologi och eller immunologi  
- Laborativt kunnande, och ffa förståelse för många metoder
- Personligt engagemang i forskning 

Ansökan skall innehålla CV, en kort beskrivning av dig och dina arbetserfarenheter. Vi ser gärna att du lämnar uppgifter om två referenspersoner. 

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad 6 månader, med möjlighet till förlängning.
Omfattningen är heltid.
Tillträde enligt överenskommelse.
Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: 
Ingrid Glimelius, ingrid.glimelius@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 17 maj 2023, UFV-PA 2023/1698.