1-2 Bioinformatiker

1–2 Bioinformatiker

Vill du arbeta med bioinformatikanalys, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som bioinformatiker på Uppsala universitet.

National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS; https://nbis.se) är en stor och snabbt växande nationell infrastruktur som främjar forskning inom livsvetenskaperna i Sverige genom att tillhandahålla support, infrastruktur och avancerad utbildning inom bioinformatikområdet. NBIS utgör bioinformatikplattformen på SciLifeLab (https://www.scilifelab.se), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade storskaliga tekniker och kunnande inom biovetenskaperna, och är också den svenska noden i den europeiska infrastrukturen ELIXIR för biologisk information.

Vi behöver nu förstärka vår kapacitet inom vår supportenhet med 1-2 bioinformatiker vid Institutionen för cell-och molekylärbiologi vid Uppsala universitet. De personer som anställs kommer att integreras i ett bioinformatikteam i en spännande forskningsmiljö med många möjligheter till utveckling av nya och existerande färdigheter för att hålla sig à jour med nya sekvenseringsteknologier och andra bioinformatiska utmaningar när de uppstår.

Arbetsuppgifter 
Vi letar efter 1-2 bioinformatikexperter som primärt kommer att arbeta med analys av spatiell omikdata eller avancerade biostatistiska och maskininlärningsanalyser, men också med andra typer av analyser. Arbetet innefattar att stödja svenska forskare inom detta område, och finansieras delvis med användaravgifter från forskargrupper. Projekten man deltar i kommer att skifta i komplexitet och längd och kommer med varierande biologiska eller medicinska frågeställningar.

Ansvarsområden inkluderar att planera, initiera, utföra och rapportera analyser, kommunicera med forskargrupper samt hålla sig uppdaterad inom fältet och bidra till NBIS avancerad utbildning av svenska forskare inom bioinformatik. Regelbundna interna möten, internutbildning och avsatt tid för utveckling av egna färdigheter är en del av arbetet. Tjänsten kommer att innebära ett visst mått av resande, eftersom kunskapsutbyte både inom och utanför NBIS är en viktig del av vår verksamhet för att behålla spetskompetens för analys av befintliga och nya datatyper.

Kvalifikationskrav
De framgångsrika sökande behöver uppfylla följande krav:

• Doktorsexamen inom något av följande områden: bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller ett angränsande fält som arbetsgivaren bedömer relevant för anställningen.
• Erfarenhet av arbete (minst 3 år) med avancerad bioinformatikanalys av omikdata
• Erfarenhet, samt förmåga att genomföra och kritiskt evaluera sådana analyser till en internationellt sett hög standard antingen en eller båda av;
  • analyser av spatial omik data såsom uttrycksdata, proteomik data eller masspektrometri. Erfarenhet av omik data från enskilda celler är också önskvärt
  • avancerade biostatistik eller maskininlärningsanalyser som multivariat analys, regularisering, deep learning eller nätverksbaserad, Baysiansk eller matris faktoriseringar för multi-omik integrering.
• Förmåga att, på internationellt konkurrenskraftig nivå, självständigt driva support-projekt och utföra dataanalys relaterade till omikdata.
• God förmåga i ett skriptspråk såsom R eller Python, samt att arbeta effektivt i Linux kommandoradsmiljö och på storskaliga datorkluster
• Mycket god förmåga att kommunicera på engelska, både i tal och skrift, samt förmåga att kommunicera med forskare med olika bakgrunder.
• Stor vikt kommer att läggas på personliga egenskaper som är relevanta för tjänsten såsom förmåga att driva projekt självständigt, förmåga att samarbeta och arbeta i en serviceinriktad organisation och vilja att lära sig nya metoder och utveckla nya färdigheter.

Önskvärt/meriterande i övrigt

• Erfarenhet av support och undervisning inom bioinformatik.
• Postdoktoral erfarenhet.
• Starka färdigheter i experimentell design och mjukvaruutveckling är också meriterande.
• ”Reproducerbar forskning” och ”FAIR data” är centrala koncept för oss, och expertis i utveckling av reproducerbar kod genom användande av koddelningsplattformar, arbetsflödesspråk, och container-lösningar är en stark merit. 

Hänsyn kommer också ges till god samarbetsförmåga, driv och oberoende, samt hur bra sökandes erfarenhet och färdigheter kompletterar och stärker NBIS verksamhet.

Ansökan
Ansökan ska innehålla CV med referenser och ett personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter.  

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde snarast eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala 

Upplysningar om anställningen lämnas av: Anna Johansson, anna.johansson@scilifelab.se 

Välkommen med din ansökan senast den 31 augusti 2025, UFV-PA 2025/2128.