Institutionen för farmaceutisk biovetenskap, Farmaceutisk bioinformatik

Institutionen för farmaceutisk biovetenskap är en interdisciplinär miljö där 10 forskningsområden arbetar för att bidra till bättre läkemedel och en friskare värld. Med laboratorier i hjärtat av Uppsala Biomedicinskt Centrum och Sveriges enda Farmaceutiska fakultet utgör vi en vital motor i utvecklingen av utbildning och forskning inom de farmaceutiska vetenskaperna.  Mer information om institutionen och dess verksamhet finns på uu.se/farmbio.

Arbetsuppgifter
Datahantering och analys av data från cellprofileringsexperiment med Cell Painting och high-content imaging. Djupinlärning och multivariata metoder, supervised och unsupervised. Utveckling av mjukvaror och pipelines för analys och storskalig hantering av bilddata. Deltagande i VR/SciLifeLab infrastrukturen Chemical Biology Consortium Sweden (CBCS).


Forskningsgruppens webbsida: https://pharmb.io/
CBCS webbsida: https://www.cbcs.se/

 Kvalifikationskrav

  • Mastersexamen i bioinformatik, datavetenskap, datateknik, vetenskaplig beräkning eller närliggande område
  • Dokumenterad erfarenhet av AI-metoder för analys av tabulära dataset och bildbaserad data, inklusive djupa neurala nätverk
  • Dokumenterad erfarenhet av bildanalys
  • Stark kompetens inom Python-programmering och Linux/HPC-miljöer
  • Stark kompetens inom storskalig datahantering och filsystem
  • Tidigare erfarenhet av virtualisering och mjukvaruutveckling
  • Goda sociala färdigheter och förmåga att arbeta med flera parallella projekt
  • Förmåga att arbeta både i team och självständigt samt lösa problem på egen hand
  • Förmåga att dokumentera kod och projekt samt interagera med forskare från andra discipliner
  • Utmärkta kommunikationsfärdigheter i skriftlig och muntlig engelska är ett krav 

Önskvärt/meriterande

  •  Erfarenhet av analys av data från cellbaserade försök med mikroskopi 

Om anställningen
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde 2025-04-21 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Ola Spjuth, e-post ola.spjuth@uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 15 april 2025, UFV-PA 2025/823

Anställningsform Särskild visstidsanställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 2025-04-21 eller enligt överenskommelse
Löneform Fast månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2025/823
Kontakt
  • Marina Rönngren, 018-4710000
Facklig företrädare
  • Seko Universitetsklubben, seko@uu.se
  • ST/TCO, tco@fackorg.uu.se
  • Saco-S-föreningen, saco-s@uu.se
Publicerat 2025-03-27
Sista ansökningsdag 2025-04-15
Logga in och sök jobbet

Dela länkar

Tillbaka till lediga jobb