Doktorand i evolutionär genetik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med personal och studenter från hela världen.  Vår forskning omfattar allt från evolutionär ekologi och genetik till studier av ekosystem. Se vidare www.ieg.uu.se.

Vi söker nu en doktorand i evolutionär genomik, med specifik inriktning på biologi och evolution av lavars fotobionter till programmet för Evolutionsbiologi.

Projektbeskrivning
Lavar är symbiotiska organismer som består av svampar, fotobionter (alger som samarbetspartner) och bakterier. De har en avgörande roll, särskilt i kalla miljöer och bidrar betydligt till biogeokemiska cykler och trofiska interaktioner. Ny forskning antyder att lavfotobionter spelar avgörande roller i lavars anpassning till olika miljöer, ändå är mekanismerna bakom detta dåligt förstådda. Dessutom har frånvaron av omfattande genomisk data om lavfotobionter resulterat i en begränsad förståelse för deras biologi och evolution, från arterdiversitet och utbredningsområden till genomiska egenskaper och adaptiva förmågor.

Detta projekt syftar till att adressera betydande kunskapsluckor inom lavbiologi och evolution. Mer specifikt kommer doktoranden att undersöka den genetiska mångfalden, de fylogenetiska relationerna och de genomiska egenskaperna hos lavfotobionter. Dessutom kommer studenten att studera populationsstrukturen, utbredningsområdena och spridningsmekanismerna hos de vanligaste lavfotobionterna - de gröna algarterna från släktet Trebouxia. Denna forskning kommer att etablera en solid grund för framtida lavstudier och har potential att ge banbrytande insikter i biologin och evolutionen av en av de viktigaste men dåligt förstådda symbiotiska partner - lavfotobionterna.

Under hela doktorandprogrammet kommer studenten att lära sig och använda en kombination av bioinformatiska metoder, molekylärt laborativt arbete, odlingstekniker och experimentella studier av fotobionter, tillsammans med mikroskopitekniker. Studenten kommer att integrera metoder från fylogenomik, jämförande genomik och populationsgenetik för att analysera data.

Ioana Onut Brännströms forskning omfattar olika aspekter av lavars evolution, från att studera lavsvampars fylogeografi och parningssystem till att utforska påverkan av naturliga och antropogena faktorer på lavfotobionter.

Arbetsuppgifter 
Kandidaten kommer att vara ansvarig för att utföra molekylärt laboratoriearbete, inklusive DNA/RNA-extraktion, kvantitativ PCR, preparering av sekvenseringsbibliotek och sekvensering med användning av korta och långa sekvenseringstekniker. Dessutom kommer doktoranden att ansvara för att odla Trebouxia-axeniska kulturer, genomföra experimentella evolutionstudier på kulturer, analysera olika typer av 'omics'-data och använda mikroskopitekniker för att beskriva morfologiska egenskaper hos identifierade Trebouxia-arter. Vi förväntar oss att kandidaten aktivt deltar i de dagliga aktiviteterna i forskargruppen och vid programmet/avdelningen.

Kvalifikationskrav
Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

• avlagt examen på avancerad nivå inom Evolutionär biologi, systematisk biologi, populationsgenomik eller ett relaterat område.
• fullgjort minst 240 högskolepoäng varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
• på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Kandidaten förväntas förstå grundläggande principer inom evolutionär biologi och/eller systematik. Kompetens i eller ett starkt intresse för att lära sig molekylärt laborativt arbete, odling och underhåll av alggemenskaper, samt bioinformatiska analyser är avgörande.

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom passion för upptäckter, initiativförmåga, kreativt tänkande och stresstålighet. Den ideala kandidaten bör ha ett genuint intresse för vetenskaplig forskning, trivas i en samarbetsinriktad miljö och förväntas ta initiativ och ansvar för egna uppgifter och projekt. Vi söker en kandidat som kan förbli motiverad och effektiv trots motgångar. Kandidaten ska ha mycket god förmåga att uttrycka sig på engelska i såväl tal som i skrift.

Meriterande
Färdigheter i våtlabbstekniker samt grundläggande kunskaper i Linux och andra datorspråk.

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde 2024-05-01 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer.

Upplysningar om anställningen lämnas av
Forskare, Gruppledare, Ioana Onut Brännström, ioana.brannstrom@ebc.uu.se.

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska innehålla 1) ett brev som beskriver dig själv, dina forskningsintressen, varför du vill doktorera och varför just du är lämplig för tjänsten, 2) ditt CV (max 2 sidor), 3) en kort beskrivning av din utbildning, 4) en kopia av din masterexamen och dina kursbetyg samt en kopia av din masteruppsats 5) namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (e-postadress och telefonnummer), och 6) eventuella publikationer. Ansökan bör skrivas på engelska.

Välkommen med din ansökan senast den 18 Mars 2024. UFV-PA 2024/510.