Doktorand i evolutionär genomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som alla fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden till vad vi gör ligger i biologi, men vår forskning överlappar med andra områden såsom medicin, datavetenskap, matematik, kemi, ingenjörsvetenskaper och fysik. Institutionen har över 200 anställda med runt 60 doktorander. Läs gärna mer om verksamhetens arbete på https://icm.uu.se. 

Doktorandtjänsten kommer att vara placerad i Jan Anderssons forskargrupp på programmet för Molekylär evolution. https://www.icm.uu.se/molekylar-evolution/ 

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Projektbeskrivning
Projektet syftar till att med hjälp av storskalig sekvensering, jämförande genomik och fylogenianalus studera evolutionär genomik hos mikrobiella eukaryoter (protister). I huvudsak kommer gruppen diplomonader och dess närmaste släktingar att studeras. Vissa i gruppen är patogener för människor och andra djur, medan andra är fritt levande. Vi är intresserade av hur den mångfalden har uppstått och mer generellt hur protister anpassar sig till olika miljöer.

Arbetsuppgifter 
Arbetet kommer till största del bestå av bioinformatiska analyser av tillgänglig och i projektet genererad sekvensdata, i huvudsak från protister. Det innebär t.ex. de novo assembly av sekvensdata, genomannotering, fylogenetiska analyser och jämförande genomik. En mindre del av arbetet kan involvera mikrobiologiskt laborativt arbete.
Doktoranden ska främst ägna sig åt sin egna forskarutbildning, övrig tjänstgöring vid institutionen kan förkomma så som undervisning och administrativt arbete, dock högst upp till 20% av tjänsten. Mer information om utbildning på forskarnivå, behörighetskrav och antagnings bestämmelser finns på fakultetens hemsida, http://www.teknat.uu.se/utbildning/utbildning-pa-forskarniva/

Kvalifikationskrav

Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

• avlagt examen på avancerad nivå inom bioinformatik, evolutionsbiologi, molekylärbiologi, eller annat ämne som arbetsgivaren bedömer som likvärdigt, eller
• fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
• på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Den sökande ska ha god förmåga att arbeta självständigt såväl som i grupp. Goda skriftliga och muntliga färdigheter i engelska är ett måste, då arbetet sker i en internationell miljö. Att arbeta kreativt, målinriktat och strukturerat är centrala under en doktorandutbildning och kommer därför att beaktas särskilt.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Tidigare erfarenhet av att arbeta med sekvensdata och bioinformatiska metoder, samt vana av att arbeta i Linux och förmåga att utveckla skript inom åtminstone ett programmeringsspråk såsom Python, R eller Perl är högst meriterande. Tidigare erfarenhet av standardmetoder inom mikro- och molekylärbiologi och arbete med protister är också meriterande, men inget krav.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer.

Ansökan: Din ansökan ska innehålla:

• Personligt brev där du beskriver dig själv, ditt forskningsintresse, dina erfarenheter samt varför du är intresserad av doktorandtjänsten (max 2 sidor).
• CV innehållande utbildning och andra meriter samt beskrivning av relevanta kunskaper utifrån kraven för tjänsten.
• Vidimerade kopior på examensbevis samt kopia av ditt examensarbete.
• Kontaktinformation till två referenspersoner

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Jan Andersson, tel. 0701-679598, jan.andersson@icm.uu.se,

Välkommen med din ansökan senast den 14 augusti 2023, UFV-PA 2023/2375.