Forskningsassistent inom neurodegenerativa och metabola sjukdomar - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Forskningsassistent inom neurodegenerativa och metabola sjukdomar med koppling till störd sömn

Precisionsmedicin innebär att kunna skräddarsy diagnostik och behandlingar utifrån genetik, miljö och livsstil. I detta projekt kommer vi utifrån kohortstudier och kompletterande avancerade interventionsstudier att identifiera biomarkörer inom området neurodegenerativa och metabola sjukdomar, i samspel med sömn och dygnsrytmer.

Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 900 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på www.medsci.uu.se

Anställningen är på 12 månader och kommer att bedrivas vid enheten för Transplantation and regenerativ medicin.

Projektet avser använda både systembiologi och precisionsmedicin för att etablera nya diagnostiska verktyg, biomarkörer och behandlingsterapier för komplexa hjärnsjukdomar, med inriktning på epilepsi, neurokognitiva sjukdomar (såsom Alzheimers sjukdom) och sömnstörningar. Patienterna kommer att undersökas vid flera tidpunkter, inklusive olika tider på dygnet, då olika typer av prover och patient-karakteristika samlas in, inom ramen för ett större EU-samarbete.

Insamlade prover och data, däribland analyserade blodbaserade proteinnivåer, kommer användas för att kunna skräddarsy diagnostik och prognos, samt att kunna förutsäga behandlingssvar. Utöver sömnregistreringar och aktivitetsdata, kommer vi även att samla in data om hur ämnesomsättningen ser ut hos dessa individer, för att kartlägga ifall sådana parametrar kan förutsäga olika sjukdomsvariabler och hur ämnesomsättningen ser ut.

Parallellt kommer vi att använda interventionsstudier med provtagning i välkontrollerade sömnlaboratorier. Inriktningen kommer att vara undersökningar kring hur sömn och livsstilsfaktorer interagerar med vanliga folkhälsosjukdomar som drabbar kognitionen samt ämnesomsättningen, såsom typ 2-diabetes. Även här kommer ett av delmålen vara att finna nya biomarkörer, t.ex. molekyler i blod eller i tarmens tarmflora.

I projektet kommer du att få medverka i ett väsentligen laborativt arbete. Målet att finna nya biomarkörer, i ett samarbete med forskare från flera länder (framförallt EU-länder). Målet är att få djupare insikt om viktiga sjukdomar som drabbar hjärnan, med fokus på sömn, ämnesomsättningen och neurodegenerativa sjukdomar, dvs. några av vår tids stora hälsoutmaningar.

Utöver erfarenhet om sömn och dygnsrytmer, kommer du i vår grupp ha möjlighet att skaffa dig laborativ erfarenhet. Du kommer också att ha möjligheter till författarpositioner på manuskript, samt att delta i flera olika forskningssamarbeten.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Arbetsuppgifter  

• Hantering och insamling av prover för blodbaserade analyser av biomarkörer. Proverna samlas in från olika patientkategorier och interventionsstudier. Syftet är att i den större projektguppen kunna identifiera nya biomarkörer och sjukdomsmekanismer, vilka är specifika för olika typer av neurokognitiva och metabola störningar.
• Samarbete med partnergrupperna inom EU-Horizon-projektet MES-CoBraD, för provhantering och ovanstående provanalyser, både i labet och vid etablerade faciliteter vid Uppsala universitet.
• Delaktig i olika biomarköranalyser (t.ex. ELISA-analyser, eller multiplex-panelanalyser).
• Delta i riktade analyser av relevans för kognitionen, neurodegenerativa förändringar och förändringar i ämnesomsättningen t.ex. mätning av nivåer av stresshormoner, och olika hormoner och ämnen som reglerar ämnesomsättningen.

Kvalifikationskrav

• Grundexamen inom relevant område såsom farmaci, biokemi, biomedicin eller inom annat relevant område.
• Erfarenhet av laborativa projektarbeten och forskningsprojekt, eller kliniskt arbete. Sökande som har dokumenterad erfarenhet av laborativt eller kliniskt relevant arbete kommer att prioriteras.
• Erfarenhet av blodprovshantering eller annan provrörshantering. Erfarenhet av basalt laborativt arbete såsom pipettering av olika volymer.
• Erfarenhet av att assistera vid kliniska studier
• Av stor vikt är även personliga kvalifikationer, såsom förmågan att interagera med andra forskare i vårt team. Du ska vara strukturerad, van att föra anteckningar, och kunna arbeta effektivt och noggrant, både enskilt och i grupp.

Kvalifikationerna styrks, i den mån det är möjligt, i form av rekommendationsbrev eller annan relevant dokumentation, tex. PM eller akademisk uppsats.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Kunskaper om bioinformatiskt relevant arbete t.ex. bearbetning av större datamängder eller tidsupplöst data, erfarenhet av olika pipelines och visualiserings-miljöer t.ex. ggplot2, illustrator, programmering i andra (skript)språk, t.ex. R, pyton, MATLAB, erfarenhet av forskningssamarbeten och projektorganisation. Relevanta specifika typer av våtlabs-arbete, t.ex. med ELISA-metoder, immunohistokemi, pipettering, qPCR och western blotting.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad i 12 månader. Omfattningen är 100%. Tillträde enligt överenskommelse, dock senast 1 maj 2023. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Jonathan Cedernaes, jonathan.cedernaes@medsci.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 7 mars 2023, UFV-PA 2023/594.