Forskningsassistent i mikrobiota-analys - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 900 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på: www.medsci.uu.se

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Projektbeskrivning
Thomas Tängdéns forskargrupp forskar kring antibiotika och resistenta bakterier. Syftet med det pågående projektet är att analysera olika antibiotikas påverkan på intestinal mikrobiota. Det är känt att antibiotika påverkar mikrobiotans sammansättning och bidrar till selektion av resistenta bakterier men effekten på mikrobiotan med olika behandlingsalternativ vid vanliga infektioner, t ex urinvägsinfektioner, är inte studerad med moderna sekvenseringsmetoder. I detta projekt utförs djup metagenomik för att detektera mikrobiotans diversitet. Odling med selektiva medier, MIC-bestämning och PCR/sekvensering utförs för att påvisa förekomst av resistenta bakterier. Studierna ger viktig ny information om förändringar i mikrobiotan vid antibiotikabehandling. Om skillnader påvisas i ekologisk effekt med olika preparat kan det påverka framtida behandling.

Arbetsuppgifter
Analysera data från kliniska studier kring tarmens normalflora.

Kvalifikationskrav
Grundläggande examen inom Biomedicin eller annat relevant ämnesområde samt vidareutbildning inom t.ex. infektionsbiologi, molekylärbiologi eller mikrobiologi är ett krav, liksom ett gott praktiskt handlag i laboratoriet och visad förmåga att arbeta självständigt. Det är också en fördel om du i övrigt har praktisk erfarenhet av mikrobiologiskt arbete med inriktning mot bakterier och antibiotika som t.ex. MIC-testning, avdödningsförsök och sekvensanalys av stammar, framförallt analys av mikrobiota. Goda datorkunskaper bland annat inom MS Excel och MS Word är ett krav samt erfarenhet av hantering och analys av sekvensdata med programvaran CLC Workbench eller dylikt. Goda kunskaper i engelska är ett krav. Vid rekryteringen kommer stor vikt att läggas vid personliga egenskaper såsom samarbetsförmåga och kommunikationsförmåga. Du är ansvarskännande, strukturerad och metodisk i ditt arbete, du har lätt att se samband och du innehar god slutledningsförmåga samt påvisar gott omdöme.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av analys av mikrobiota är meriterande.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, 5 månader. Omfattningen är 100 %. Tillträde 16 januari 2023 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Thomas Tängdén (huvudhandledare), 0708-370323, thomas.tangden@medsci.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 30 december 2022, UFV-PA 2022/4962.