Forskare (senior postdoc) i proteomik och eukaryotisk evolution - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vid institutionen för organismbiologi bedriver vi undervisning och forskning om evolution, utveckling och funktion på organismnivå. För mer information se www.iob.uu.se.

Tjänsten är placerad i Fabien Burkis forskargrupp (https://www.burki-lab.net/) inom programmet Systematisk biologi vid Institutionen för organismbiologi (Evolutionsbiologiskt centrum, Uppsala universitet). I Burki-labbet studerar vi den breda mångfalden av eukaryoter, som huvudsakligen är mikrobiell, för att förstå några av de viktigaste övergångarna i bred eukaryotevolution, såsom plastidernas ursprung.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Projektbeskrivning
Burki-lab tilldelades nyligen ett ERC Consolidator-anslag (PlastidOrigin) som syftar till att studera en av de mest omvälvande händelserna i eukaryot evolution – ursprunget till de fotosyntetiska organellerna (de primära plastiderna) i Archaeplastida. Huvudsyftet med denna postdoc/forskartjänst är att producera de första plastidproteomen för röda alger med hjälp av helcellsspatialproteomik med hyperLOPIT-metoden (eller alternativt LOPIT-DC). Genom att kombinera dessa data med verifierade proteom för andra arkeplastider, och genom att söka efter homologer i andra eukaryoter och prokaryoter, vill vi karakterisera ursprunget för plastidproteiner och storleken på de endosymbiotiska gentemot icke-endosymbiotiska plastidproteomfraktionerna bland arkaeplastiderna. Beroende på kandidatens expertis kan en utbildningsperiod anordnas utomlands.

Arbetsuppgifter
Bygga upp kunskap och arbetsflöden för proteomiska experiment i labbet i samarbete med en lokal proteomikfacilitet. Anpassa hyperLOPIT till rödalger. Ta fram kulturer av tillräcklig täthet och köra hyperLOPIT. Med hjälp av Machine Learning prediktera proteincellulär placering samt analysera data i kontext av plastidevolution. Sprida resultaten i lämpliga format såsom vi konferenser och i ledande peer-reviewade publikationer. Handledning av juniora medarbetare liksom andra arbetsuppgifter inom forskargruppen, vilket inkluderar arbetsuppgifter för att bidra till ett väl fungerande labb, kan komma att ingå. Sökanden bör vara villig att resa för kortare (konferenser) eller längre perioder om utbildning behövs.

Kvalifikationskrav
Doktorsexamen i biologi, kemi eller likvärdig examen. Vi söker en entusiastisk person med viljan att samarbeta kring etableringen av en ny metodik. Sökanden ska ha en stark, givet sitt karriärsstadie, lista av högkvalitativa vetenskapliga publikationer. Stor vikt läggs vid personliga egenskaper som hög motivation, planerings- och organisationsförmåga, problemlösning och förmåga att arbeta under arbetstoppar. Vi har en vänlig stämning inom forskargruppen och gentemot andra anställda på arbetsplatsen så kollegial förmåga att arbeta som en del av ett team är viktig.

För den här tjänsten krävs dokumenterad erfarenhet av masspektrometri och proteomik, styrkt av vetenskapliga publikationer inom dessa områden. Stort intresse för evolution, särskilt avgörande transitioner i eukaryot evolution, såsom plastidernas ursprung. Sökanden ska behärska kommandorad och R för kvantifiering och statistisk analys samt ha goda kunskaper i minst ett skriptspråk (t.ex. Python). Behärska engelska i tal och skrift.

Önskvärt/Meriterande i övrigt
Kunskaper om metoder för subcellulär fraktionering, hyperLOPIT eller LOPIT-DC. Erfarenhet av arbete med cellkulturer, särskilt alger.

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde 2023-01-01 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Fabien Burki, +46 18 471 2779, fabien.burki@ebc.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 3 november 2022, UFV-PA 2022/3361.