Uppsala universitet, Institutionen för organismbiologi

Vid institutionen för organismbiologi bedriver vi undervisning och forskning om evolution, utveckling och funktion på organismnivå. För mer information se www.iob.uu.se.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet

Tjänsten är placerad i forskargruppen Andermann (https://katalog.uu.se/empinfo/?id=N22-999) inom Systematisk biologi vid Institutionen för Organismbiologi (Evolutionsbiologiskt centrum, Uppsala universitet). Tjänsten kommer att ingå i forskarskolan SciLifeLab Datadriven Life Science (DDLS) (https://www.scilifelab.se/data-driven/about/), och har unika utbildnings- och kursmöjligheter inom DDLS-nätverket.

I forskargruppen Andermann arbetar vi på skärningspunkten mellan beräkningsbiologi och forskning om biologisk mångfald. Vi utvecklar nya beräkningsmetoder och arbetsflöden för fältarbete/labbarbete för att kvantifiera komplexiteten i biologisk mångfald, med fokus på landbaserade system. Vår vision är att en dag på ett tillförlitligt sätt kunna fånga biologiska mångfalden av en given plats på ett standardiserat och reproducerbart sätt. Vi är en ung och dynamisk forskargrupp med uppdraget att genom vår forskning bidra till att lindra den pågående krisen inom biologiska mångfald. Vi värdesätter innovativa idéer, en kollegial och icke-hierarkisk atmosfär och högkvalitativ och effektfull forskning. Och framför allt tycker vi om det vi gör!

Arbetsuppgifter/Projektbeskrivning
Huvudfokus för denna doktorandtjänst kommer att vara att utveckla AI-modeller och/eller andra modelleringsmetoder i syfte att förutsäga den biologiska mångfaldens kapacitet/potential för en given plats. Även om biologisk mångfald är mycket komplex är en bra utgångspunkt att fokusera på artrikedom eller rikedom på andra taxonomiska nivåer. Data som användas för träning av dessa modeller kommer att vara biologiska mångfaldsdata genererad inom vår grupp såväl som av lokala och internationella samarbetspartners, till stor del bestående av genetiska data som härrör från miljö-DNA-sekvensering. Exempeldataset för inledande utvecklingsarbete är redo att sammanställas och analyseras omedelbart. Prediktorer som används i dessa modeller kommer att inkludera biotisk såväl som abiotisk features, inklusive högupplösta data som genereras av moderna fjärranalystekniker (t.ex. satellitbilder och luftburen laserskanningsdata).

Kvalifikationskrav
Magister- eller masterexamen, om 240 högskolepoäng (hp) vara minst 60 hp på avancerad nivå inom relevant ämne. Relevanta ämnen innefattar biologi, maskininlärning, datavetenskap, geovetenskap, fjärranalys, bioinformatik, genomik eller liknande. Vi söker en mycket motiverad kandidat som tycker om utmaningar och som självständigt kan utforska nya idéer. Den ideala kandidaten har en bakgrund i att arbeta med att implementera maskininlärningsmodeller eller andra statistiska modeller och har programmeringskunskaper i Python, R eller liknande. En forskningsbakgrund inom biologiska eller geologiska vetenskaper är önskvärt men intresserade studenter med datavetenskaplig eller datavetenskaplig bakgrund är mycket välkommen att också söka. Kandidaten bör ha utmärkt kommunikationsförmåga (engelska i tal och skrift).

Önskvärt/meriterande i övrigt
Universitetet har för avsikt att rekrytera den person som, utifrån en sammanvägd bedömning av kompetens, färdigheter och dokumenterade kvalifikationer, bedöms som lämpligast att bedriva projektet samt bidra till en positiv utveckling av avdelningen.

Erfarenhet av fjärranalysdata, biologiskt mångfaldsmått och/eller spatiala analyser är meriterande.

Anställningen
Anställningen är fyra år och personen kommer huvudsakligen att ägna sig åt sin egen forskning. Om undervisning eller annan institutionstjänstgöring på maximalt 20 procent ingår i anställningen kan en förlängning beviljas upp till högst fem år. Löneplacering sker i enlighet med lokala riktlinjer vid Uppsala universitet. Sökanden måste vara berättigad till doktorsexamen vid Uppsala universitet.

Information om forskarutbildning finns på webbplatsen för Naturvetenskapliga fakulteten, http://www.teknat.uu.se/Doktorand/.

Ansökningsförförande
Ansökan ska innehålla 1) ett brev som beskriver dig själv, dina forskningsintressen och din motivation till varför du vill ha doktorandtjänsten, 2) en kort beskrivning av din utbildning, 3) ditt CV, 4) kopior av examensbevis och betyg, 5) namn och kontaktinformation (adress, mejl och telefonnummer) till minst två referenspersoner, 6) relevanta publikationer (inklusive masteruppsatsen). Ansökan måste vara skriven på engelska.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Tobias Andermann, tobias.andermann@ebc.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 31 augusti 2022, UFV-PA 2022/2451.

Anställningsform Tidsbegränsad anställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 2023-01-01 eller enligt överenskommelse
Löneform Fast lön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100 %
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2022/2451
Facklig företrädare
  • ST/TCO, tco@fackorg.uu.se
  • Seko Universitetsklubben, seko@uadm.uu.se
  • Saco-rådet, saco@uadm.uu.se
Publicerat 2022-06-22
Sista ansökningsdag 2022-08-31

Tillbaka till lediga jobb