Postdoktor i immunologisk genomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 900 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på www.medsci.uu.se.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Forskargruppen i reumatologi med inriktning mot systemisk autoimmunitet vid Institutionen för medicinska vetenskaper söker en postdoktor. Forskargruppen studerar inflammatoriska reumatiska sjukdomar, såsom systemisk lupus erythematosus (SLE) och Sjögrens syndrom. Vi har en omfattande verksamhet där vi undersöker arvsmassan och celler från patienter och friska personer, där syftet är att förstå orsaken till sjukdomsprocesserna så att ny och effektiv behandling kan utvecklas. Vi samarbetar i nationella och internationella nätverk med kliniker och forskare, men även med läkemedelsindustrin. För mer information om forskargruppen se: http://www.medsci.uu.se/forskning/reumatologi/

Arbetsuppgifter
Vår forskargrupp har bidragit till att identifiera genvarianter (single nucleotide polymorphisms, SNPs) i >25 genområden som är associerade med ökad risk att utveckla SLE. Vissa av dessa risk-SNP:ar är även kopplade till specifika sjukdomsmanifestationer. Nyligen utvecklade vi ett polygenetisk riskscore för SLE och fann att personer med hög genetisk risk inte bara oftare drabbades av sjukdomen utan även får en svårare sjukdom. Detta projekt syftar till att vidare studera genetikens betydelse för patogenesen och den kliniska bilden vid SLE. Målsättningen är att utveckla ett genetiskt instrument för att prediktera sjukdomens fenotyp, effekt av olika miljöfaktorer samt respons av behandling. För detta arbete har vi analyserat och sammanställt genetisk data, metyleringsdata, proteinuttryck samt omfattande kliniska data från ett stort antal patienter med SLE. Arbetet innefattar analys av gen-gen och gen-miljö interaktioner samt utvecklande av modeller för att med genetisk information prediktera framtida sjukdomsförlopp. Projektets övergripande mål är att utveckla ett instrument som kan användas i klinisk praxis.

Vi förväntar oss att vår nya kollega självständigt kan planera och utföra analyser i samarbete med det övriga teamet. God förmåga att presentera data och skriva manuskript är också viktigt.

Kvalifikationskrav
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer etc.

• Doktorsexamen(PhD) i medicin, biologi, bioinformatik eller genetik
• Erfarenhet av genetiska och statistiska analyser inkluderande analys av GWAS-data (PLINK, R)
• Förmåga att tolka omics data i en biologisk kontext
• Författarskap i peer-granskade vetenskapliga publikationer av hög kvalitet
• God förmåga att arbeta självständigt Intresse för att dela med sig av sin kunskap till kollegor
• God förmåga till kommunikation i tal och skrift på engelska
• Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet, i synnerhet förmåga att arbeta tillsammans med andra forskare, läkare och bioinformatiker

Önskvärt/meriterande i övrigt
Dokumenterad erfarenhet av genetisk interaktionsanalys och utveckling av genetiska prediktionsmodeller. Erfarenhet av att använda högpresterande datorer för dataanalys (t.ex. Uppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational Science) är också meriterande.

Ansökan:
Ansökan ska innehålla ett brev där den sökande beskriver motiveringen till att söka denna tjänst samt relevanta kvalifikationer. Ansökan ska också innehålla en meritförteckning (CV), kopior av examensbevis, en lista över publikationer samt kontaktinformation (namn, e-post, telefonnummer) till två referenspersoner. Ange tidigaste möjliga startdatum.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning, 2 år.

Lön: Individuell lönesättning.

Anställningens omfattning: Heltid.

Tillträde: September 2022 eller enligt överenskommelse.

Upplysningar om anställningen lämnas av: MD PhD Lektor Dag Leonard (dag.leonard@medsci.uu.se) eller PhD, Bioinformatiker Ahmed Sayadi (ahmed.sayadi@ebc.uu.se).

Välkommen med din ansökan senast den 13 juni 2022, UFV-PA 2022/1854.