Projektassistent i SBDI - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Härmed utlyses en tjänst som projektassistent i biodiversitetsdata-hantering till programmet för evolutionsbiologi.
Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med medarbetare och studenter från hela världen. Vid institutionen bedrivs forskning och undervisning i skärningspunkten mellan ekologi, evolution och genomik. Se vidare www.ieg.uu.se.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Projektbeskrivning
Inom ramen för den nationella infrastrukturen för biodiversitetsdata (SBDI) arbetar vi med att tillgängliggöra metabarcoding-data över mikrobiell mångfald från fältstationen Erken. Den data som ska hanteras består till största del av amplikon sekvenser av den bakteriella 16S regionen men även 18S data från eukaryoter kan komma att ingå. I enlighet med FAIR-principen vill vi med det här projektet göra sekvensdata och tillhörande metadata från publicerade studier tillgängligt och sökbart i SBDI (https://biodiversitydata.se).

Arbetsuppgifter
I projektet kommer kandidaten processa mikrobiella amplikondata till ASVer, samt formatera taxonomi och tillhörande metadata för publicering i SBDIs ASV-portal. Sekvensdatahantering kommer ske i arbetsflödet Ampliseq på Uppmax. Projektet kommer även bidra till utvecklingen av detta arbetsflöde.

Kvalifikationskrav
Du ska ha högskoleutbildning inom bioinformatik (eller motsvarande) på masternivå. Du måste ha praktisk erfarenhet av att hantera stora sekvensdatamängder och kunna arbeta på kommandorad i dataklustermiljö. Kandidaten ska ha god förmåga att arbeta självständigt och ta initiativ till råd och handledning när problem uppstår.

Meriterande
Kännedom om arbetsflöde och datahantering i metabarcoding studier är meriterande.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, 3 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Universitetslektor, Anna Rosling, anna.rosling@ebc.uu.se, +46 18 471 6444.

Instruktioner för ansökan: Ansökan ska innehålla Exempel: 1) ett brev som beskriver dig själv och varför du vill ha tjänsten, 2) en kort beskrivning av din utbildning, 3) ditt CV och 4) namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (e-postadress och telefonnummer).

Välkommen med din ansökan senast den 6 april 2022, UFV-PA 2022/1027.