Projektassistent - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Är du nyfiken på det snabbt växande området bioteknik? Vill du arbete i en dynamiskt och kreativ miljö vid en av Europas största verksamheter för DNA-analyser? Som projektassistent hos oss kommer du arbeta med att bearbeta sekvensdata från storskaliga sekvensinstrument, kvalitetskontroll av bearbetat sekvensdata, samt leverans av data till uppdragsgivare via Uppmax. Arbetsuppgifterna kan också komma att omfatta utvecklings-, förbättrings- och valideringsarbete i befintliga system för dataprocessning och analys.

SNP&SEQ-teknologiplattformen är en del av den Nationella Infrastrukturen för Genomik (NGI) vid SciLifeLab i Uppsala. SNP&SEQ erbjuder service med moderna storskaliga metoder och applikationer inom sekvensering (NGS), SNP-genotypning och proteomik till uppdragsgivare inom svensk akademi och industri, och även till internationella uppdragsgivare. Verksamheten består av en multidisciplinär grupp av forskare, projektkoordinatorer, forskningsingenjörer, bioinformatiker, systemutvecklare och systemadministratörer. Årligen genererar plattformen >300 terabaser av sekvensdata från >20 000 prover och levererar >25 miljarder genotyper från 50 000 prover till uppdragsgivarna. Mer om SNP&SEQ:s verksamhet finns på vår hemsida: https://ngisweden.scilifelab.se/

SNP&SEQ tillhör Institutionen för medicinska vetenskaper som är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 300 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset. Mer om institutionens verksamhet finns på: www.medsci.uu.se

Kvalifikationskrav:

• Universitets- eller högskoleexamen med inriktning mot molekylärbiologi, bioteknologi, bioinformatik, datavetenskap eller liknande.
• Mycket stor datorvana.
• Erfarenhet av arbete i Linux/Unix-miljö.
• Förmåga att snabbt lära sig nya färdigheter.
• Mycket goda kunskaper i engelska i tal och skrift.

Önskvärt och meriterande:

• Erfarenhet av programmering i Python.
• Erfarenhet av shell-skriptning i Linuxmiljö.
• Erfarenhet av dataanalys med hjälp av R-paket.
• Erfarenhet av användande av datorkluster för exempelvis storskaliga beräkningar eller dataanalys.
• Erfarenhet från analys av data från storskalig sekvensering (tex helgenom, exon eller RNA-seq) och sekvenseringsteknologier (Illumina, PacBio, ONT).
• Kunskap i metoder och tillämpningar inom molekylärbiologi och genetik (tex PCR, DNA/RNA-sekvensering, SNP-genotypning etc).
• Erfarenhet av versionskontroll med GitHub.
• Goda kunskaper i svenska i tal och skrift.
• Erfarenhet av arbete i ackrediterad miljö.

Vi söker en person med initiativförmåga, noggrannhet, ansvarskänsla samt god förmåga till både självständigt arbete och arbete i grupp.  Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper, såsom positiv attityd till serviceverksamhet och god samarbetsförmåga. Då verksamheten är ackrediterad enligt kvalitetsstandard ISO/IEC 17025 är noggrann dokumentation av det dagliga arbetet en viktig del av arbetsuppgifterna.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast, eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: 1 år.

Anställningens omfattning: Heltid, 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av: Ulrika Liljedahl, enhetschef SNP&SEQ ulrika.liljedahl@medsci.uu.se, Elin Övernäs, gruppchef sekvenseringsgruppen elin.övernäs@medsci.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 11 januari 2022, UFV-PA 2021/5005.