Doktorandplats i komparativ cancergenomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM) vid Uppsala universitet utgör en bred internationell miljö för forskning och undervisning. Institutionens forskning bedrivs inom tre samverkande och delvis interagerade sektioner; cancer, infektioner och immunitet samt genetik och genomik. En närmare beskrivning finns på http://www.imbim.uu.se/forskningsomraden/.

Vi söker en mycket motiverad kandidat med förmåga att arbeta självständigt och med ett starkt intresse för att genomföra en forskarutbildning vid Uppsala universitet i komparativ cancergenomik med inriktning mot både människor och hundar. Studieplanen är inriktad på att identifiera gener som ligger till grund för osteosarkom hos hundar och människor samt gener som ligger bakom glioblastom.

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter: Forskargrupperna Lindblad-Toh vid IMBIM, UU och Forsberg-Nilsson vid IGP, UU, har ett starkt fokus på genomisk analys av icke-kodande mutationer som påverkar genreglering i hjärntumörer och osteosarkom. Doktoranden kommer att utföra bioinformatiska analyser av sekvenseringsdata, med fokus på tumörmutationer i genomdata från hundar och människor. Dessutom förväntas studenten interagera med kollegor på labbet kring utformning och tolkning av experimentell validering av resultaten från de bioinformatiska analyserna. Vi använder helgenomsekvenseringsdata från tumörer och normal vävnad, RNA-seq-data och integrerar olika databasresurser för att identifiera och ytterligare studera tumörmutationer som potentiellt kan reglera genuttryck.

Kvalifikationskrav: Kandidaten ska ha en magisterexamen eller motsvarande (motsvarande 240 hp) med fokus på bioinformatik, cancergenomik och/eller evolutionär genetik. Stark kompetens inom programmering är också ett krav. Mycket god muntlig och skriftlig kommunikationsförmåga på engelska krävs. Tyngdpunkt kommer också att läggas på personliga egenskaper som samarbets- och kommunikationsförmåga samt analytisk kapacitet. Kandidaten förväntas ta egna initiativ samt samarbeta med nationella och internationella kollegor både inom och utanför gruppen.

Bedömning sker enligt följande kriterier: uppfyllande av behörighetskrav, betyg på kurser, hur väl kurserna passar projektet, samt tidigare erfarenhet av arbete och/eller forskning inom områden som relaterar till projektet enligt beskrivningen ovan. En sammantagen bedömning görs för att anställa den person som anses mest lämpad att klara doktorandstudierna och bidra till en positiv utveckling av programmet.

För anställning som doktorand krävs att innehavaren är antagen eller kommer att antas till forskarutbildning, där graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning är avgörande.

Information om utbildning på forskarnivå, behörighetskrav och antagningsbestämmelser finner du på http://www2.medfarm.uu.se/utbildning/forskarniva/. Studietiden (på heltid) är maximalt fyra år.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap 1-7 §§. Innehavare av doktorandanställning skall främst ägna sig åt egen forskarutbildning. Övrig tjänstgöring vid institutionen, som avser utbildning och administrativt arbete, kan ingå inom ramen för anställningen (max 20%).

Ansökan: Ansökan mottages via Uppsala universitets ansökningsportal och förväntas innehålla i) den sökandes kompletta CV, samt ii) ett brev som beskriver kandidatens bakgrund, forskningsintresse och motivation till att söka den utlysta tjänsten, namn och e-post/tel.nr. till två referenspersoner.

Lön: Enligt lokalt kollektivavtal för doktorander.

Tillträde: snarast eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning enl HF 5 kap § 7.

Anställningens omfattning: 100 %.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Kerstin Lindblad-Toh, kerstin.lindblad-toh@imbim.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 15 juli 2021, UFV-PA 2021/1891.