Forskningsassistent i molekylär epidemiologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för medicinska vetenskaper, Uppsala universitet, utlyser härmed en anställning som forskningsassistent i gruppen Molekylär Epidemiologi som leds av professor Tove Fall. Gruppen beforskar diabetes och kardiovaskulär sjukdom med olika metoder, allt från moderna molekylär epidemiologitekniker med ”omics” data till mer traditionella epidemiologiska tillvägagångssätt i stora dataset. Dessutom forskar vi kring tarmflorans koppling till livsstilssjukdom och forskning gällande covid-19 symptom. Forskningsmiljön är internationell och med engelska som arbetsspråk. Se https://www.medsci.uu.se/forskning/molekylar-epidemiologi/ för mer information och information om senaste publikationer. Gruppen omfattar flera medarbetare med grundlig utbildning och erfarenhet av avancerade statistiska, epidemiologiska och bioinformatiska metoder.

Arbetsuppgifter: De primära arbetsuppgifterna är att arbeta med studiedesign, dataanalys och manuskript inom GUTSY-projektet vilket finansieras av Europeiska forskningsrådet. Medarbetaren förväntas att utveckla metoder för att integrera mikrobiom- och metabolomdata.

Det övergripande målet med detta projekt är att utreda orsakssambandet mellan tarmfloran och aterosklerotisk sjukdom samt att identifiera lättillgängliga biomarkörer kopplade till ateroskleros-kopplas tarmflora. För detta ändamål har forskningsprogrammet tre huvudmål: 1) Identifiering av tarmflora (mätt med metagenomik) associerad med koronarsjukdom, hos 10 000 individer 2) Identifiering av plasmamarkörer (metabolomics) associerade med en ateroskleros-kopplad tarmflora 3) Klargörande av kausala effekter av tarmflora vid ateroskleros, hjärtinfarkt och stroke genom utveckling av nya genetiska instrument och tillämpning av Mendelian randomiseringsanalys. Projektet förväntas leda till nya vägar för att effektivt förebygga aterosklerotisk sjukdom.

Att notera är att inget laboratoriearbete är planerat inom projektet. I övrigt kommer de data som sökanden kommer att arbeta med att kureras, så ingen masspektrometri, bildbehandling eller sekvensdata behöver hanteras. De viktigaste statistiska programvarorna som används i gruppen är Stata, R och PLINK och vi arbetar ofta i en UNIX-miljö.

Vi söker en mycket högmotiverad och detaljorienterad forskningsassistent med intresse för epidemiologi och genetik.

Kvalifikationskrav:

• Masterexamen i life sciences
• Erfarenhet av hjärt- och kärlforskning
• Erfarenhet av epidemiologisk forskning, särskilt grundläggande förståelse av observationsstudier av populationsstudier
• Dokumenterad erfarenhet av epidemiologisk forskning baserad på molekylära data eller/och sambanden mellan tarmfloran och nivåer av olika cirkulerande biomarkörer
• Erfarenhet av arbete i Linux/UNIX-servermiljö, inklusive skriptspråk (Bash, R eller liknande)
• Erfarenhet av genomföra analys i R samt har dokumenterad erfarenhet av att analysera big data
• Kunskap om ett eller flera av följande programvaruverktyg: PLINK och SLURM
• Dokumenterad erfarenhet av att utveckla analysmetoder och dokumentera arbete korrekt
• Mycket god förmåga att arbeta självständigt och samarbeta i en internationell grupp
• Erfarenhet av att arbeta logiskt, metodiskt och strukturerat
• Utmärkt förmåga till kommunikation i tal och skrift på engelska

Meriterande i övrigt: Kunskap/erfarenhet inom följande områden är meriterande:

• Kombinerade omics-analyser (t.ex. epigenomik, transcriptomik, metagenomik)
• Mendelsk randomisering
• Statistik (multivariabla modeller)
• Mikrobiologi
• Programmering
• Genetisk epidemiologi inklusive GWAS
• Maskininlärning
• Medicin
• Visualisering av forskningsresultat

Ansökan: Följande dokument ska bifogas till din ansökan. Ansökan kan gärna vara skriven på engelska:

• Personligt brev (max 2 sidor) där du kort beskriver dig själv och dina forskningsintressen samt motivering till varför du söker denna anställning
• Fullständigt CV, inklusive tidigare akademiska utnämningar, akademisk titel, nuvarande sysselsättning, undervisningserfarenhet samt kompetens/erfarenhet inom olika programvaror
• Kopior av examensbevis och betyg från tidigare utbildning
• Namn och kontaktuppgifter på tre referenser

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tillsvidareanställning, provanställning kan komma att tillämpas.

Anställningens omfattning: 100 %.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Tove Fall, tove.fall@medsci.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 8 april 2021, UFV-PA 2021/1119.