Postdoktor i sjö- och växtplanktonmodellering - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med medarbetare och studenter från hela världen. Vid institutionen bedrivs forskning och undervisning i skärningspunkten mellan ekologi, evolution och genomik. Se vidare www.ieg.uu.se.

Avdelningen för limnologi bedriver forskning inom akvatisk ekologi, mikrobiell ekologi och biogeokemi. Vår forskning fokuserar både på grundläggande förståelse för sjöarnas ekologi och tillämpad forskning som kan stödja skötseln av sjöar och reservoarer. Fältstationen Erken har en lång historia av limnologisk forskning, inklusive ett sjöövervakningsprogram.

Projektbeskrivning:

Postdoktorn kommer att delta i det EU-sponsrade projektet BLOOWATER som utvärderar metoder och strategier för att göra det möjligt för anläggningar för rening av dricksvatten att bättre hantera konsekvenserna av de allt vanligare cyanobakterierna. Som en del av detta projekt kommer kandidaten att hjälpa till med att utvärdera olika modelleringsmetoder som potentiellt kan användas för att förutsäga sannolikheten för blomning, som i sin tur kan användas för att förbereda för förändringar i vattenreningen.

Tre metoder kommer att utvärderas.
1) Användning av processbaserade modeller som förutsäger förekomsten av generiska cyanobakteriegrupper
2) Användning av maskininlärningsalgoritmer matade genom mätningar från tillgängliga sjöövervakningsdata och tränade i observationer av uppmätta fytoplanktonkoncentrationer
3) En hybridstrategi på 1 och 2 som inkluderar biofysiska data (vattentemperatur, blandningshastigheter, ljusnivåer etc.) från processbaserade simuleringar till maskininlärningsalgoritmer.  

Modellutveckling och testning kommer att göras med hjälp av data från sjöarna Erken och Mälaren i Sverige och sjöarna Albano och Castreccioni i Italien. 

Postdoktorn kommer att arbeta som medlem av en grupp som också består av mastersstudenter och doktorander. Det förväntas att postdoktorn kommer att arbeta för att hjälpa alla medlemmar i gruppen att uppnå gemensamma mål, och att postdoktorn kommer att ta en ledande roll i utvecklingen av studier relaterade till BLOOWATER-projektet.

Arbetsuppgifter:

• Köra befintlig hydrotermisk och vattenkvalitetsmodell för Erken och utveckla modelluppsättningar för andra sjöar av intresse.
• Utveckla bearbetade algoritmer och optimeringsmetoder som förbättrar modellprestanda för att simulera förekomsten av cyanobakterier.
• Utveckla och testa maskininlärningsalgoritmer som förutsäger förekomsten av cyanobakterier. Testa dessa med hjälp av data från alla sjöar som används i BLOOWATER-projektet.
• Utvärdera möjligheterna att använda data från processbaserade simuleringar för att förbättra maskininlärningsalgoritmer.

Kvalifikationskrav:

För anställning som postdoktor ska du ha doktorsexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom limnologi, oceanografi, civilingenjör, miljövetenskap eller ett relaterat ämne. Examen ska ha avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan examen vara äldre än tre år. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer etc.

Kandidaten ska ha tidigare erfarenhet av att simulera miljöförhållanden med antingen processbaserade modeller eller maskininlärningsbaserade algoritmer. Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom förmågan att arbeta både självständigt och som en del av en aktiv forskargrupp. Kandidaten ska ha mycket bra förmåga att uttrycka sig på engelska, i såväl tal som skrift. 

Meriterande:

• Erfarenhet av att utveckla maskininlärningsapplikationer med allmänt tillgänglig programvara med öppen källkod som Tensorflow / Keras eller PyTorch
• Erfarenhet av numeriska sjölägen
• Kunnig i datorprogrammering - erfarenhet av R och / eller PYTHON och / eller FORTRAN ett plus
• Förmåga att hantera och analysera stora datamängder producerade av numeriska modeller.
• Intresse för samhällsfrågor relaterade till klimatförändringar och vattenförvaltning.

Instruktioner för ansökan: Ansökan ska innehålla 1) ett brev som beskriver dig själv, dina forskningsintressen, varför du vill ha tjänsten och varför just du är lämplig för tjänsten, 2) ditt CV, 3) en kort beskrivning av din utbildning, 4) en kopia av din doktorsavhandling och dina betyg, 5) namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (e-postadress och telefonnummer) och 6) relevanta publikationer. Önskvärt att ansökan skrivs på engelska.

Lön: Individuell lönesättning.

Tillträde: 2021-01-25 eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning i 24 månader år enligt centralt kollektivavtal.

Anställningens omfattning: 100%.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Don Pierson, don.pierson@ebc.uu.se, +46 18 471 5399.

Välkommen med din ansökan senast den 31 December 2020. UFV-PA 2020/4571.