1 forskningsingenjör i translationell genomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (www.igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, patologi, neuroonkologi, vaskulärbiologi, strålningsvetenskap samt molekylära verktyg. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar och masterprogram inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 420 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. 

1 forskningsingenjör i translationell genomik - Överföring av resultat från storskaliga genetiska studier för kardiometaboliska sjukdomar hos människa genom att använda zebrafisk som modellsystem.

Projektbeskrivning: Storskaliga associeringsstudier av hela genom (GWAS) har identifierat hundratals genetiska loci som är starkt associerade med kardiometaboliska riskfaktorer och sjukdomar. I de flesta fall förblir de kausala generna, d.v.s de gener som ligger bakom förändringarna, fortfarande okarakteriserade. Innan resultaten från GWAS kan översättas till klinisk användning – till exempel som nya biomarkörer eller som läkemedelsmål – måste vi identifiera och karakterisera de kausala generna i dessa loci. Den senaste utvecklingen inom CRISPR/Cas9-baserad mutagenes, high-throughput mikroskopi och bildbaserade analyser har visat att sebrafisk är ett lovande modellsystem för systematisk, storskalig, genetisk karakterisering.

Det övergripande målet för det här projektet är att identifiera och karakterisera kausala gener i GWAS identifierade loci för kardiometabola riskfaktorer och sjukdomar med hjälp av bildbaserade zebrafiskmodellsystem.

Projektet syftar till att använda validerade bild- och CRISPR/Cas9-baserade sebrafiskmodellsystem, för att karakterisera 200 kandidatgener med en förväntad roll i kardiometaboliska riskfaktorer och sjukdomar. Framgångsrika kandidater kommer att arbeta tillsammans i ett team som annars består av av en PI, projektkoordinator, forskningsingenjörer, postdoktorer och doktorander.

Arbetsuppgifter: Forskningsingenjören kommer att ansvara för att implementera rutiner i vår zebrafiskanläggning för att optimera underhållet av zebrafisklinjen samt hälsa, fertilitet och produktivitet för zebrafisk. Andra viktiga uppgifter inkluderad: 1) CRISPR gRNA-syntes och mikroinjektion för att generera grundare; 2) testa den mutagena effektiviteten hos gRNA med användning av fragmentlängd PCR-analys (FLA); 3) avbildning larver för sjukdomsrelaterade egenskaper med användning av ett automatiserat positioneringssystem och fluorescensmikroskop; 4) bereda prover för ytterligare experiment, såsom biokemi och sekvensering eller FLA; 5) objektiv kvantifiering av avbildningsdata med hjälp av befintliga skript; och 6) datahantering och kvalitetskontroll av data. Helgarbete kan inträffa.

Framgångsrika kandidater kommer att att placeras i Marcel den Hoeds forskargrupp (http://igp.uu.se/ forskning/genetik_genomik/marcel-den-hoed/). Projektet finansieras av ett samarbete med industrin.

Kvalifikationskrav: Ansökningar accepteras från mycket motiverade kandidater med en examen i marinbiologi eller liknande och minst två års erfarenhet av att arbeta med sebrafisk som forskningsdjur. Erfarenhet av att arbeta med automatiserad fluorescensmikroskopi är också en förutsättning. En framgångsrik kandidat bör vara en mycket motiverad, organiserad, pålitlig lagspelare som också kan arbeta självständigt. Att kunna planera och prioritera i enlighet med projektmål och deadlines är viktiga egenskaper av en lyckad kandidat. Förkunskap om, och erfarenhet av sebrafiskhållning krävs. Förkunskaper om och erfarenhet av mikroinjektioner, CRISPR-baserad mutagenes, datahantering och/eller bildbaserade analyser är meriter. Skriftliga och muntliga kunskaper i engelska är ett krav.

Ansökan ska innehålla ett brev som beskriver dig själv, dina forskningsintressen, dina erfarenheter av ovan nämnda uppgifter, och din tillgänglighet; ett CV; en verifierad förteckning över kursbetyg; samt kontaktuppgifter till minst två referenspersoner. Om det finns kan ett BSc / MSc examensbevis och rekommendationsbrev också ingå.

Lön: Individuell lönesättning.

Tillträde: 2020-08-01 eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tillsvidareanställning, provanställning kan tillämpas.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av: Marcel den Hoed, PhD, phone +46-70-425 07 52,  marcel.den_hoed@igp.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 16 juli 2020, UFV-PA 2020/2562.