Forskningsassistent i molekylär epidemiologi med inriktning på tarmflorans betydelse för hjärtkärlsjukdom - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för medicinska vetenskaper, Uppsala universitet, utlyser härmed en anställning som forskningsassistent i gruppen Molekylär Epidemiologi. Gruppen beforskar diabetes och kardiovaskulär sjukdom med olika metoder, allt från moderna molekylär epidemiologitekniker med ”omics” data till mer traditionella epidemiologiska tillvägagångssätt i stora dataset. Forskningsmiljön är internationell och med engelska som arbetsspråk (se tovefall.se för mer information och information om senaste publikationer). Gruppen omfattar flera medlemmar med grundlig utbildning och erfarenhet av avancerade statistiska, epidemiologiska och bioinformatiska metoder.

Arbetsuppgifter: De primära arbetsuppgifterna inom den planerade tjänsten är att arbeta med studiedesign, dataanalys och manuskript inom GUTSY-projektet vilket finansieras av Europeiska forskningsrådet.

Det övergripande målet med detta projekt är att utreda orsakssambandet mellan tarmfloran och aterosklerotisk sjukdom samt att identifiera lättillgängliga biomarkörer kopplade till ateroskleros-kopplas tarmflora. För detta ändamål har forskningsprogrammet tre huvudmål: 1) Identifiering av tarmflora (mätt med metagenomik) associerad med koronarsjukdom, hos 10 000 individer 2) Identifiering av plasmamarkörer (metabolomics) associerade med en ateroskleros-kopplad tarmflora 3) Klargörande av kausala effekter av tarmflora vid ateroskleros, hjärtinfarkt och stroke genom utveckling av nya genetiska instrument och tillämpning av Mendelian randomiseringsanalys. Projektet förväntas leda till nya vägar för att effektivt förebygga aterosklerotisk sjukdom.

Gruppen består av cirka tolv personer och verkar inom den nya Epi-Hubben på Dag Hammarskjölds väg 14, där cirka 30 aktiva epidemiologer och statistiker har sin dagliga arbetsplats, vilket möjliggör samarbete och stöd i en unik miljö.

Att notera är att inget laboratoriearbete är planerat inom projektet. I övrigt kommer de data som sökanden kommer att arbeta med att kureras, så ingen masspektrometri, bildbehandling eller sekvensdata behöver hanteras. De viktigaste statistiska programvarorna som används i gruppen är Stata, R och PLINK och vi arbetar ofta i en UNIX-miljö. Medarbetaren kommer att kunna utveckla sina färdigheter genom kurser och även utbyta besök med andra forskningsgrupper.

Kvalifikationer: Den ideala kandidaten är en mycket högmotiverad person med masterexamen i ett relevant ämne för forskningsprojektet, och dokumenterad erfarenhet av epidemiologisk forskning baserad på molekylära data eller sambanden mellan tarmfloran och nivåer av olika cirkulerande biomarkörer.

Mycket goda kunskaper i skriftlig och muntlig engelska krävs. Sökanden måste uppvisa vetenskapliga publikationer av hög kvalitet i internationella peer-granskade tidskrifter som förstaförfattare.

Grundläggande förståelse av observationsstudier av populationsstudier är vidare ett krav. Personliga egenskaper är viktiga. Sökanden bör vara stringent i sin analysmetodik särskilt avseende forskningsetik, ha en ansvarsfull attityd, en logiskt och strukturerat arbetssätt och kunna arbeta självständigt. Sökanden måste visa förmåga att dokumentera sitt arbete korrekt. Sökanden ska också kunna dela sin kunskap med kollegor muntligt och i text. Sökanden ska självständigt kunna genomföra analys i R samt har dokumenterad erfarenhet av att analysera big data.

Meriterande i övrigt:

Kunskap/erfarenhet inom följande områden är meriterande:

• Kombinerade omics-analyser (t.ex. epigenomik, transcriptomik, metagenomik)
• Mendelsk randomisering
• Statistik (multivariabla modeller)
• Mikrobiologi
• Programmering
• Genetisk epidemiologi inklusive GWAS
• Maskininlärning
• Hjärt- kärlsjukdom
• Medicin
• Visualisering av forskningsresultat

Ansökan: 

Följande dokument måste lämnas in med din ansökan och helst skriven på engelska:

• Ett fullständigt CV, inklusive tidigare akademiska utnämningar, akademisk titel, nuvarande ställning och undervisningserfarenhet samt kompetens/erfarenhet inom olika programvaror
• En fullständig publikationslista
• En kortfattad text (max 1 sida) av varför du söker denna position och dina intressen och mål
• Utskrifter av betyg från tidigare utbildning
• Namn och kontaktuppgifter för tre referenser

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: snarast eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning till april 2021.

Anställningens omfattning: 100 %

För ytterligare information om anställningen vänligen kontakta: Tove Fall tove.fall@medsci.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 29 juni 2020, UFV-PA 2020/2308.