Projektledare med kompetens i bioinformatik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Forskargruppen i molekylär medicin (https://molmed.medsci.uu.se) vid Institutionen för medicinska vetenskaper, Uppsala universitet har haft en ledande roll vid utveckling av metodik för analys av genetisk variation och för etablering av storskaliga SNP-analyser och ”nästa generationens” DNA sekvensering  (NGS) i Sverige. Gruppen som leds av prof Ann-Christine Syvänen består av doktorander, forskningsingenjörer och disputerade forskare som är engagerade i genetiska och epigenetiska studier av i barnleukemi och autoimmunitet med hjälp av både experimentella och bioinformatiska metoder.  Forskargruppen i molekylär medicin önskar nu rekrytera en vikarierande projektledare med kompetens i bioinformatik till sitt helgenomsekvenserings (WGS)-projekt i akut barnleukemi (ALL). Projektet är ett av de nationella WGS-projekten som delfinansieras av SciLifeLab (https://www.scilifelab.se/research/national-projects/). bioinformatiker.

Arbetsuppgifter

• Att säkerställa projektets framåtskridande
• Att leda och utföra bioinformatiska analyser av WGS-data från patienter med ALL tillsammans med övriga bioinformatiker i gruppen för molekylär medicin .
• Att utveckla den strategiska planen för data-analyserna i projektet
• Att utföra analyser av WGS-data från leukemipatienter vid SNIC-UPPMAX
• Att samordna data-analyserna i gruppen för molekylär medicin och bionformatiker vid den nationella bioinformtikinfrastukturen (NBIS/WaBI).
• Att följa litteraturen inom cancergenomiken.
• Att presentera projektet på relevanta externa seminarier och konferenser samt vid gruppens interna möten.
• Att ansvara för att skriva utkast för publikationer på basen av analysresultaten.
• Att vid delta i vetenskapliga diskussioner inom forskargruppens övriga projekt.

Kvalifikationskrav

Doktorsexamen (PhD) i molekylärbiologi, molekylärgenetik, molekylär bioteknologi, molekylär evolution, bioinformatik eller annat relevant område samt gedigen erfarenhet av bioinformatiska analyser av genomdata. Tidigare erfarenhet av projektledning samt erfarenhet av att leda andra.

Mycket goda programmeringskunskaper, t.ex. i Perl, R, Python, C++ och Unix/Linux samt erfarenhet av att analysera storskaligt data på datorkluster.  God förmåga i att uttrycka sig på och engelska i tal och skrift. Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper såsom förmåga till självständigt arbete, kommunikationsförmåga och samarbetsförmåga,  förmåga att arbeta välstrukturerat och målmedvetet.

Övrigt meriterande eller önskvärt

Kunskap om de experimentella genomikmetoderna samt om cancergenomik och molekylär evolution anses meriterande. Förmåga att läsa och tala basal svenska anses som meriterande.

Lön: Enligt överenskommelse

Tillträde : Snarast möjligt

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning tom september 2020

Omfattning: 100%

Upplysningar om anställningen:
Professor Ann-Christine Syvänen, ann-christine.syvanen@medsci.uu.se,
Tel 070-7813411, 018-4714688

Välkommen med din ansökan senast den 5 oktober 2018, UFV-PA 2018/3194.