Doktorand i evolutionär och ekologisk genetik

Doktorand i evolutionär och ekologisk genetik
Vill du bedriva banbrytande forskning i en framstående miljö inom evolutionsbiologi vid Sveriges största fakultet för naturvetenskap och teknik? Institutionen för ekologi och genetik vid Uppsala universitet bedriver världsledande forskning inom biologi, från molekyler till ekosystem och globala biodiversitetsmönster. Vi söker nu en doktorand som vill utveckla sin forskarkarriär tillsammans med oss.

Institutionen för ekologi och genetik (IEG) vid Evolutionsbiologiskt centrum (EBC) är en internationell miljö där våra medarbetare bedriver forskning för att förstå ekologiska och evolutionära processer på alla nivåer av biologisk organisation. IEG erbjuder tillgång till avancerade nationella och lokala forskningsinfrastrukturer, inklusive superdatorresurser (NAISS) och de senaste molekylära teknologierna och sekvenseringsplattformarna (SciLifeLab-plattformar). IEG har ett klimatlaboratorium med kontrollerade miljökammare och växthus, ett toppmodernt molekylärt laboratorium, samt anläggningar för djuruppfödning. Doktorander vid IEG kan ansluta sig till forskarskolan, som erbjuder goda möjligheter till nätverkande både på och utanför campus med doktorander från de två andra biologiska institutionerna vid Uppsala universitet (Institutionen för organismbiologi och Institutionen för cell- och molekylärbiologi).

Tjänsten erbjuds inom forskningsprogrammet för Zooekologi vid IEG. Programmets nuvarande forskning omfattar populations-genomik och kvantitativ genetik, lokal anpassning, artinteraktioner, livshistorie-evolution, artbildning, sexuell selektion, bevarande-genomik samt makroekologi. Ytterligare information om programmet för djurekologi finns här.

Arbetsuppgifter
En central fråga inom evolutionsbiologi är om evolutionära förändringar är upprepbar och om samma gener bidrar till upprepade fenotypiska anpassningar. Denna fråga har viktiga implikationer för vår förmåga att kunna förutsäga genetiska responser på förändrade miljöer. Nya studier visar att även om fenotypisk evolution ofta är upprepbar, kan de underliggande generna som bidrar till dessa förändringar vara mindre förutsägbara. Detta innebär en utmaning för användningen av genomiska data för att förutsäga en arts evolutionära potential. Detta projekt kommer att ta sig an denna utmaning genom att integrera mekanistiska insikter om fenotypisk anpassning med genomiska data för att förstå hur arter utvecklar anpassningar till förändringar i sin miljö.

Doktoranden kommer att arbeta med huvudhandledaren David Berger samt biträdande handledaren, SciLifeLab-fellow Dr. Gabriela Montejo-Kovacevich, båda vid IEG. Projektet kommer att utnyttja data från ett storskaligt Evolve-and-Resequence-experiment på en utbredd skadeinsekt, fröbaggen Callosobruchus maculatus. Replikerade genetiska linjer har genomgått experimentell evolution under fyra olika temperaturregimer i mer än 150 generationer. Detta unika system möjliggör studier av determinismens och slumpens roll i utvecklingen av temperatur-tolerans och nischbredd. Omfattande fenotypiska data, RNA-seq och DNA pool-seq-data finns tillgängliga från flera tidpunkter i experimentet, som fortfarande pågår. Berger-gruppen upprätthåller även flera andra geografiska populationer av C. maculatus samt närbesläktade arter av fröbaggar. Detta ger möjligheter till komparativ genomik samt ytterligare experiment och datainsamling om kandidaten önskar vidareutveckla projektet.

Doktorandprojektet kommer att innefatta en kombination av experimentellt och molekylärt laboratoriearbete samt bioinformatisk analys, med tyngdpunkt på det senare. Den exakta fördelningen mellan arbetsuppgifterna kan bero på kandidatens intressen och projektets utveckling.

Den framgångsrika kandidaten förväntas samarbeta med andra forskare i Bergers och Montejo-Kovacevichs grupper, samt forskare från ytterligare två grupper som arbetar med fröbaggar vid IEG.

Doktorander vid Institutionen för ekologi och genetik (IEG) har möjlighet att delta i undervisning och att utveckla sitt pedagogiska CV genom att gå kurser. Typ och omfattning av undervisningen beror på tillgång och studentens intressen men får inte överstiga 20 % av heltid. Undervisningen kommer främst att bestå av att assistera i grundutbildningskurser inom biologiområdet. Anställning och finansiering förlängs motsvarande den tid som läggs på undervisning.

Vi förväntar oss att kandidaten aktivt deltar i forskargruppens dagliga verksamhet (personliga möten med PI, gruppmöten, utbildning) samt i programmets/institutionens aktiviteter (gemensamma seminarier, journal clubs).

Vidare läsning:
Rêgo, Alexandre m.fl. ”Repeatability of Evolution and Genomic Predictions of Temperature Adaptation in Seed Beetles”. Nature Ecology & Evolution, 2025, 1–14. https://doi.org/10.1038/s41559-025-02716-5.

Burc, Estelle m.fl. ”Life-History Adaptation under Climate Warming Magnifies the Agricultural Footprint of a Cosmopolitan Insect Pest”. Nature Communications 16 (2025): 827. https://doi.org/10.1038/s41467-025-56177-2.

Kvalifikationskrav
För att uppfylla behörighetskraven för doktorandstudier måste du: 

• ha en magisterexamen (andra cykeln) i evolutionsbiologi, ekologi, bioinformatik eller ett relaterat område, eller
• ha avslutat minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 poäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt projekt värt minst 15 poäng, eller
• ha förvärvat motsvarande kunskaper på annat sätt (t.ex. omfattande forskningserfarenhet).

Den ideala kandidaten bör även:
Ha god förståelse för centrala begrepp inom ekologi och/eller evolutionsbiologi/genetik.
Ha erfarenhet av eller visat intresse för programmering.
Ha personliga egenskaper såsom stark initiativförmåga, god arbetsmoral och en entusiasm för lärande.
Vara mycket motiverad och nyfiken samt trivas i en samarbetsinriktad miljö.
Kunna ta ansvar för att genomföra och slutföra självständiga uppgifter och projekt.
Kunna uttrycka sig väl i både talad och skriven engelska.

Meriterande
Följande kompetenser är särskilt meriterande:
Erfarenhet av statistiska analyser tillämpade på kvantitativ genetisk eller populationsgenomisk data.
Erfarenhet av arbete med bioinformatiska pipelines på servrar och kluster.
Erfarenhet av molekylärt laboratoriearbete (t.ex. DNA-extraktioner och/eller biblioteksberedning).
Experimentellt arbete, såsom erfarenhet av experimentell evolution eller arbete med genetiska linjer.

Om anställningen
Anställningen är en tidsbegränsad tjänst enligt högskoleförordningen kapitel 5 §7. Omfattning: heltid (100%). Tillträdesdatum: 2026-09-01 eller enligt överenskommelse. Placering: Uppsala Universitet.

Regler för doktorander framgår av högskoleförordningen kapitel 5, §§ 1–7 samt av Uppsala universitetets regler och riktlinjer.

Upplysningar om anställningen lämnas av
Universitetslektor, David Berger, david.berger@ebc.uu.se

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska innehålla: 

1) Ett brev där du beskriver dig själv, dina forskningsintressen, varför du vill genomföra en doktorandutbildning och varför du är lämplig för tjänsten. 

2) Ditt CV. 

3) En kort beskrivning av din utbildning. 

4) En kopia av din masterexamen och dina kursbetyg samt en kopia av din masteruppsats. 

5) Namn och kontaktuppgifter till minst två referenser (e-postadresser och telefonnummer). 

6) Eventuella publikationer, om tillämpligt. 

Ansökan ska vara skriven på engelska. 

Välkommen med din ansökan senast den 22:a Maj, 2026. UFV-PA 2026/853.