Avdelningschef för NBIS (National Bioinformatics Infrastructure Sweden)

Avdelningschef för NBIS (National Bioinformatics Infrastructure Sweden)

Vill du arbeta med avancerad bioinformatiksupport till svenska forskare inom livsvetenskaperna, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som avdelningchef på Uppsala universitet.

Institutionen för cell- och molekylärbiologi (ICM) är en av de mest internationella, breda och framstående biomolekylära institutionerna i Europa. Institutionens forskningsområden är indelade i sju forskningsprogram som och täcker allt från cellbiologi till biofysik av enskilda molekyler. Den person vi söker kommer att vara placerad vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi och knuten till National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS) och Science for Life Laboratory (SciLifeLab). 

NBIS är en distribuerad nationell forskningsinfrastruktur finansierad av Vetenskapsrådet, Knut & Alice Wallenbergs stiftelse, SciLifeLab och svenska universitet. Syftet med NBIS är att tillhandahålla bioinformatiksupport och infrastruktur till forskare inom livsvetenskaperna. NBIS har ca 120 experter över hela landet inom olika områden såsom DNA-, RNA- och proteinanalyser, systembiologi, genomanalyser, masspektrometri-proteomik, metabolomik. NBIS har också experter inom systemutveckling och datahantering. NBIS utgör den svenska noden i den europeiska infrastrukturen ELIXIR för biologiska data. Mer information om NBIS finns på https://nbis.se.

Arbetsuppgifter
Inom NBIS finns en avdelning för Support som framför allt arbetar med avancerad bioinformatiksupport till svenska forskare inom livsvetenskaperna. NBIS söker nu en avdelningschef för att leda supportexpertgrupperna Health and Clinical, som är inriktad mot medicinska, kliniska och hälsovetenskaper. Arbetet består i att bland annat ombesörja bemanning av projekt, ansvara för prioritering av arbetsuppgifter och balansering av experternas arbetsbörda. Avdelningschefen har från prefekten delegerat ansvar för medarbetar- och lönesamtal för de experter som är anställda vid ICM; för övriga experter vid andra universitet ingår verksamhetsansvar inklusive medarbetarsamtal. Sammantaget ingår ledningsansvar i olika former för en grupp om ca 10 support-experter, fördelade över 2–3 olika universitet. Då experterna kommer att finnas både vid Uppsala Universitet och vid andra universitet i Sverige är kommunikation och koordinering en viktig arbetsuppgift. 

Vidare ingår ett ansvar att utveckla och kvalitetssäkra NBIS:s Health and Clinical support genom utveckling av rutiner, kommunikation med användare och rekrytering av ny personal. I tjänsten ingår också att representera NBIS vid olika symposier och konferenser samt att driva projekt inom den europeiska organisation ELIXIR, där NBIS utgör den svenska noden. Undervisning på NBIS:s/ELIXIR:s avancerade kurser ingår också.

Kvalifikationskrav

• Doktorsexamen inom bioinformatik eller annat relevant ämne inom livsvetenskaperna
• Postdoktoral forskningserfarenhet.
• Docentur i för anställningen relevant ämne.
• Dokumenterad flerårig erfarenhet att leda support-verksamhet för bioinformatik.
• Minst 8 års erfarenhet från arbete med nationell forskningsinfrastruktur, inklusive att självständigt driva supportprojekt och utföra dataanalyser relaterande till omik-data.
• Mycket god erfarenhet av arbete (minst 8 år) med avancerade bioinformatikanalyser av olika omikdata inkluderande pre-processning, men med fokus på nedströms statistiska och algoritmiska analyser.
• Mycket god förmåga att arbeta i skriptspråk, såsom R eller Python, med bioinformatik-pipelines, speciellt Snakemake, samt att arbeta effektivt i Linux kommandoradsmiljö och på storskaliga datorkluster.
• Långvarig (minst 10 år) dokumenterad egen forskning och erfarenhet av utveckling av statistiska analyser, probabilistiska modeller, Bayesiansk statistik samt effektiva algoritmer för dessas implementering.
• Dokumenterad erfarenhet av utveckling av programvaror inom bioinformatik eller beräkningsbiologifältet.
• Mycket god förmåga att kommunicera på svenska och engelska, både i tal och skrift, samt kommunicera med forskare med olika bakgrunder.

Önskvärt/meriterande i övrigt

• Mycket god förmåga i programmering, speciellt C++.
• Erfarenhet av AI-tekniker och dess användning inom livsvetenskaperna.
• Erfarenhet av relevanta verktyg och metoder för reproducerbar forskning och ”FAIR data”.
• Handledarerfarenhet och pedagogisk skolning och erfarenhet.
  
  

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare (provanställning kan tillämpas). Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Bengt Persson, bengt.persson@icm.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 25 februari 2025, UFV-PA 2025/391.