Forskare i retrovirus-värd evolution - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM) vid Uppsala universitet utgör en bred internationell miljö för forskning och undervisning. Institutionens forskning bedrivs inom tre samverkande och delvis interagerade sektioner; cancer, infektioner och immunitet samt genetik och genomik. En närmare beskrivning finns på http://www.imbim.uu.se/forskningsomraden/.

Forskargrupp Jern vid IMBIM söker härmed en motiverad och driven forskare med ett uttalat intresse att arbeta med retrovirus-värd evolution.

Projektbeskrivning: Forskargrupp Jern studerar samutvecklingen mellan retrovirus och värdarter (https://imbim.uu.se/forskargrupper/genetik-och-genomik/Jern_Patric/). Gruppen utnyttjar de senaste landvinningarna inom storskaliga sekvenseringsprojekt och använder bioinformatik för att studera spår av retrovirus i arvsmassor hos människa, husdjur och andra ryggradsdjur för att öka förståelse för retrovirusevolution och dess effekter på arvsmassans funktion och utveckling.

Arbetsuppgifter: Bedriva forskning inom projekt som syftar till att studera retrovirusdiversitet och samutveckling med värddjur från analys av storskaliga sekvenseringsdata och endogena retrovirus som identifieras i DNA från ryggradsdjur. I arbetet ingår bioinformatik och metodutveckling för identifiering och annotering av sekvensvariation hos endogena retrovirus inom och mellan arter och dess populationer for att studera spridning samt kartlägga evolutionära interaktioner mellan retrovirus och deras värddjur. I arbetet ingår även att säkerställa reproducerbar forskning genom noggrann dokumentation och publicering av vetenskapliga artiklar. Viss undervisning kan ingå.

Kvalifikationer: Doktorsexamen inom bioinformatik, genomik, eller ett område som arbetsgivaren anser vara likvärdigt. Dokumenterad erfarenhet av bioinformatiska analysmetoder samt storskalig sekvensanalys och populationsgenetik, liksom programmeringskunskaper i Bash, R, Perl eller Python. Mycket god muntlig och skriftlig färdighet i engelska krävs. Kandidaten förväntas vara initiativrik och utveckla projektet, samt angelägen att dokumentera arbetet för reproducerbar forskning och samarbeta såväl med gruppens övriga medlemmar som med nationella och internationella samarbetspartners. Stor vikt läggs vid personlig lämplighet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: 1 Maj 2021 eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning 1 år med eventuell möjlighet till förlängning.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar lämnas av: Docent Patric Jern, patric.jern@imbim.uu.se

Ansökan mottages via Uppsala Universitets ansökningsportal och förväntas innehålla 1) CV, 2) ett kortfattat brev som beskriver bakgrund, forskningsintresse och motivation till att söka den utlysta tjänsten, 3) kontaktinformation för två referenser (telefon och epostadress).

Välkommen med din ansökan senast den 11 Mars 2021, UFV-PA 2021/678.