Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 45 000 studenter, mer än 7 000 anställda och en omsättning på cirka 7 miljarder kronor.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (www.igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, patologi, neuroonkologi, vaskulärbiologi, strålningsvetenskap samt molekylära verktyg. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar och masterprogram inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 420 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. 

Arbetsuppgifter/Projektbeskrivning: Postdoktorn kommer att handledas av Dr. Weronica Ek och vara anställd i Dr. Åsa Johanssons forskargrupp (https://www.uu.se/en/research/ ai4research/ och https://igp.uu.se/research/genetics_genomics/asa-johansson/). Projektet kommer att fokusera på genetik/genomik och epidemiologiska studier av reumatiska sjukdomar. Den primära uppgiften är att analysera storskalig kohort och registerdata, vilket kommer att inkludera både analys av riskfaktorer (t.ex. fetma, hormonnivåer, livsstil och diet), protein biomarkörer, samt genetiskdata (GWAS, hel-exom- (WES) samt helgenomsekvensdata (WGS)), där vi har ett särskilt intresse för att även utreda effekten av sällsynta genetiska varianter på risken för reumatisk sjukdom. Det sekundära målet är att estimera polygeniska riskvärden (PGS) för att identifiera individer med en ökad risk att drabbas av reumatisk sjukdom (antingen med befintliga metoder som t.ex. LD-pred, eller med metoder som utvecklas inom forskargruppen). Beroende på den sökande, så kan arbetet även komma att inkludera att analysera (eller utveckla) maskininlärning (ML) / artificiell intelligens (AI) metoder för att analysera WGS data i relation till reumatiska sjukdomar. I arbetsuppgifterna ingår planering, genomförande av dataanalys, sammanställning av resultat, samt skrivande och publicerande av vetenskapliga arbeten. I arbetet ingår även att bidra till skrivandet av forskningsansökningar och viss handledning (max 20%) av doktorander och studenter.

Kvalifikationskrav: För anställning som postdoktor ska du ha doktorsexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, i x. Examen ska ha avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan examen vara äldre än tre år. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer etc.

Specifika kvalifikationer för tjänsten är:

- Erfarenhet av bioinformatiska eller statistiska analyser av storskalig, epidemiologisk, genetisk eller transkriptionsdata.
- Dokumenterad erfarenhet av R programmering.
- God förmåga att uttrycka sig såväl muntligt som skriftligt på engelska.
- God samarbets- och kommunikationsförmåga.
- Dokumenterad erfarenhet av att sammanställa och publicera vetenskapliga artiklar inom närliggande område.

Önskvärt och/eller meriterande i övrigt:

- Erfarenhet av Mendelsk Randomisering.
- Dokumenterad erfarenhet av att använda maskininlärningsmetoder för analys av genetiska data är meriterande.
- Dokumenterad erfarenhet av forskning eller arbete med reumatiska sjukdomar och / eller inflammatoriska sjukdomar är meriterande.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Individuell lönesättning.

Tillträde: 2021-04-01 eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning på 2 år från startdatum.

Anställningens omfattning: 100 %.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Åsa Johansson, asa.johansson@igp.uu.se, Weronica Ek,weronica.ek@igp.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 4 mars 2021, UFV-PA 2021/461.

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 2021-04-01
Löneform Individuell lönesättning
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2021/461
Facklig företrädare
  • Seko Universitetsklubben, seko@uadm.uu.se
  • ST/TCO, tco@fackorg.uu.se
  • Saco-rådet, saco@uadm.uu.se
Publicerat 2021-02-18
Sista ansökningsdag 2021-03-04

Tillbaka till lediga jobb