Forskare i komparativ genetik och genomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM) vid Uppsala Universitet utgör en bred internationell miljö för forskning och undervisning. Institutionens forskning bedrivs inom tre samverkande och delvis integrerade sektioner; cancer, infektioner och försvar samt genetik och genomik.En närmare beskrivning finns på http://www.imbim.uu.se/forskningsomraden/.

Professor Lindblad-Tohs forskning ligger inom en stark forskningsmiljö vid medicinska fakulteten på Uppsala universitet och SciLifeLab. Gruppen har fokus på att använda komparativ genomik och genetik för att förstå komplexa sjukdomar, såsom cancer, immunologisk sjukdom och neuropsykiatriska sjukdomar. För att uppnå detta mål använder vi sekvenseringsdata från patienter och friska individer för att hitta sjukdomsassociationer i både hund och människa. Vi sekvenserar också många däggdjur för att förstå vilka bitar av människans arvsmassa som har en viktig funktion.

Just nu har vi ett antal stora dataset som behöver analyseras, t. ex. resekvenseringsdata för flera immunologiska sjukdomar i människa. Dessutom finns GWAS-data för cancer, atopi och renal dysplasi.

Arbetsbeskrivning: Den som anställs kommer att arbeta med många olika tekniker inklusive GWAS i hundar och associationsanalys för flera immunologiska sjukdomar där både kodande och regulatoriska delar av 1,900 kandidatgener studeras. Associationsanalyser både med individuella SNPar och aggregerande associationsmetoder kommer att användas. Identifierade loci kommer att annoteras djupare med hjälp av ytterligare finmappning, expressionsdata och andra typer av funktionella genomikdata. Du kommer även att planera och utföra funktionella experiment inklusive EMSA och “luciferase assays” tillsammans med kollegor på labbet. Du kommer att kommunicera och ha regelbundna möten med gruppledare och kollegor samt med internationella samarbetspartners efter behov. Du väntas även presentera data på gruppmöten. Arbetet kan även innebära att förbättra och uppdatera gruppens websida, att koordinera med grupper vid SLU för att förbättra biobanken m.m. Viss undervisning kan ingå.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen i genomik, husdjursgenetik, bioinformatik, genetik, eller relaterad disciplin. Väl dokumenterad erfarenhet av GWAS och resekvenserings analys. Gedigen erfarenhet av datoranalys av genomik eller andra biologiska data, dokumenterad genom medförfattarskap på publicerade artiklar. Erfarenhet av programmering i tex R. Innovativt och kreativt tänkande. Förmåga att arbeta både som del av ett team och individuellt, organisera arbetet effektivt och prioritera arbetsbördan. Förmåga att presentera data tydligt vid vetenskapliga möten. Mycket god förmåga att utrycka sig i tal och skrift på både engelska och svenska är nödvändigt. För att lyckas i den här tjänsten måste du vara initiativtagande, självgående och kunna driva saker i mål. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet där vi ser god kommunikationsförmåga, samarbetsförmåga, servicekänsla, flexibilitet och en förmåga att på ett självständigt sätt lösa problem som viktiga egenskaper.

Önskvärt/meriterande: Förmåga att analysera och tolka data från storskalig sekvensering inklusive populationsbaserad WGS och WES, RNA-seq är önskvärd. Kunskap om hundar är ett plus. Vana vid att kommunicera med hundägare är en bonus.

Ansökan måste innehålla: Ett personligt brev med en kort beskrivning av forskningsintresse samt en motivering för varför du söker tjänsten. CV inklusive publikationslista, samt kopior av relevanta diplom och kontaktuppgifter till åtminstone två referenser.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: 13 januari 2020 eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning t.o.m. 2020-12-31 med eventuell möjlighet till förlängning.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Kerstin Lindblad-Toh, kerstin.lindblad-toh@imbim.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 2 december 2019, UFV-PA 2019/3914.