Bioinformatiker inom translationell metabol forskning

Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 300 anställda och ca 900 personer som är anknutna, i huvudsak via Akademiska Sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på www.medsci.uu.se.

Enheten för Klinisk diabetologi och metabolism bedriver klinisk såväl som cell- och molekylärbiologisk forskning med fokus på typ 2-diabetes och obesitas. Vi har väl utvecklade tvärdisciplinära samarbeten lokalt (t ex inom Uppsala Diabetes Centre) och nationellt/internationellt (t ex EU Horizon-konsortium, SSF-centrum).

Arbetsuppgifter
Typ 2-diabetes och obesitas är växande globala folkhälsoproblem. Vår forskning fokuserar på betydelsen av övervikt vid utvecklingen av typ 2-diabetes, med särskild tonvikt på förändringar i fettvävnaden och dess funktion samt dess komplexa interaktioner med andra organ, särskilt hjärnan. Vi använder olika analysmetoder, inklusive omics, cell- och molekylärbiologisk metodik, energiomsättning, imaging in vitro och in vivo samt kliniska studier.

Denna anställning inriktas på bioinformatik inom projekt som syftar till ökad förståelse av övervikt och typ 2-diabetes genom två huvudsakliga tillvägagångssätt: i) att undersöka sambandet mellan övervikt/obesitas och utvecklingen av metabola följdsjukdomar, ii) utforska nya metoder för diagnostik av personer med hög risk för diabetes och andra följdsjukdomar samt för intervention innefattande diet, läkemedel och obesitaskirurgi.

Arbetsuppgifterna inkluderar:

• Avancerad dataanalys med hjälp av bioinformatikverktyg
• Analysera "omics"-data från vävnads- och blodprover
• Användning av statistiska metoder för storskalig dataanalys
• Utveckling av algoritmer för riskvärdering på individnivå

Anställningen inriktas i huvudsak på att ge bioinformatikstöd till pågående och kommande forskningsprojekt genom att integrera och tolka stora datamängder och samarbeta med tvärvetenskapliga team-medlemmar, inklusive forskare, forskningssjuksköterskor och läkare. Sökanden kommer även att bidra till studiedesign, metodutveckling, samt medverka i vetenskapliga rapporter.

Andra centrala aspekter av anställningen är kontinuerligt lärande, kommunikation av resultat, kvalitetssäkring samt medverkan i ansökningar om forskningsanslag.

Kvalifikationskrav
Avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, med biomedicinsk inriktning. Stor erfarenhet och kompetens inom bioinformatik samt dokumenterad erfarenhet av forskning inom metabola sjukdomar. Gedigen erfarenhet av R or STATA är ett krav, samt god förståelse för grundläggande molekylärbiologi. Vetenskapliga meriter i form av publikationer efter disputation.

Särskild vikt läggs vid personliga egenskaper såsom planerings-, organisations- och samarbetsförmåga. Den sökande bör vara noggrann och ansvarstagande, ha en hög forskningsetisk standard, samt kunna arbeta självständigt och i multidisciplinära grupper. Dessutom är förmågan att förmedla forskningsresultat genom både muntlig och skriftlig kommunikation viktig. Goda kunskaper i engelska och svenska språken. Stor vikt läggs vid personlig lämplighet.

Vår forskningsmiljö är internationell, med engelska som primärt arbetsspråk, och goda kunskaper i både skriftlig och muntlig engelska är ett krav.

Önskvärt/meriterande i övrigt:

Kunskap inom följande områden:

• Analys och rapportering av omics-data
• Programmering
• Genetisk epidemiologi (t ex. GWAS)
• Storskaliga epidemiologiska databaser

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, 3 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde 2025-01-01 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Prof Jan Eriksson (jan.eriksson@medsci.uu.se), Maria Pereira, PhD (maria.pereira@medsci.uu.se)

Välkommen med din ansökan senast den 8 november 2024, UFV-PA 2024/3672