Postdoktor i mikrobiell ekologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM) vid Uppsala universitet utgör en bred internationell miljö för forskning och undervisning. Vid IMBIM bedrivs grundforskning inom biokemi, cell- och molekylärbiologi, tumörbiologi, jämförande genetik, funktionell genomik, immunologi, bakteriologi, och virologi. Institutionens forskning är huvudsakligen grundläggande, men har i sin tillämpning tydlig koppling och betydelse för hälsa och sjukdom hos såväl djur som människor. En närmare beskrivning finns på https://www.imbim.uu.se/forskningsomraden/.

IMBIM utlyser en postdoktortjänst i mikrobiell ekologi till forskningsgruppen ledd av Lionel Guy.

Projektbeskrivning
Biologiska reningar används för att bryta ner organiska ämne som härstammar från massa- och pappersproduktion. Biologiska reningar kan vara en källa för Legionella, som ger en ökad infektionsrisk för arbetare och grannar. När biologiska reningar behöver stängas på grund av höga legionella halter, släpps avloppsvatten med högre koncentrationer av organiska ämnen, kväve och fosfor till floder och sjöar, vilket bidrar till övergödning. Här vill vi förstå de komplexa biotiska interaktioner som påverkar legionellatillväxt.

Resultaten som erhålls här bör identifiera faktorer och mikroorganismer som förstärker eller förhindrar tillväxt av legionella i biologiska reningar. Att minska dessa kommer att göra biologiska reningar säkrare för arbetare och grannar, öka möjlighet av vattenåteranvändning i större skala, samt möjliggöra placering närmare tätbebyggda områden för att främja energiåtervinning med t.ex. fjärrvärme.

Arbetsuppgifter
Postdoktorn kommer att undersöka mikrobiomet för flera biologiska reningar över tid med amplikon sekvensering och även mäta fysikalisk-kemiska egenskaper i slamm och avloppsvatten samt analysera biologiska reningars design. För särskilt intressanta prover kommer postdoktorn att analysera vilka mikroorganismer som finns och deras metaboliska potential genom helgenommetagenomik, med särskild fokus på Legionella spp. och protozoer. Robust multivariat statistik kommer att visa vilka mikroorganismer och vilka faktorer, fysikalisk-kemiska och processrelaterade, som bidrar till höga legionella titer.

Kvalifikationskrav
Doktorsexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom evolutionär ekologi. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.

Kandidaten ska ha fallenhet för mikrobiell ekologi och ha arbetat mycket med att analysera metagenomiska prov från olika miljö. Vidare ska kandidaten ha en god förståelse för mikrobiell evolution.

Kandidaten ska ha mycket bra förmåga att uttrycka sig på engelska, i såväl tal som skrift.

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom att samarbeta i grupper med olika kompetenser. Nyfikenhet och förmåga att arbeta självständigt och ta egna initiativ för att lösa problem är också egenskaper som kommer att vara viktiga för genomförandet av projektet.

Meriterande
Bred kunskap av legionella bakteriers ekologi och biologi. Enastående analytisk förmåga och gedigen erfarenhet av att arbeta med statistik och programspråket R. Bevisad förmåga att utforma egna vetenskapliga publikationer och att leda egna forskningsprojekt.

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad i minst 2 år och högst 3 år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 2024-01-01 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: universitetslektor Lionel Guy, lionel.guy@imbim.uu.se, +46 73 976 06 18

Välkommen med din ansökan senast den 11 december 2023. UFV-PA 2023/4491