Doktorandplats inom mikrobiomforskning med fokus på oral mikrobiota

Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM) vid Uppsala universitet utgör en bred internationell miljö för forskning och undervisning. Vid IMBIM bedrivs grundforskning inom biokemi, cell- och molekylärbiologi, tumörbiologi, jämförande genetik, funktionell genomik, immunologi, bakteriologi, och virologi. Institutionens forskning är huvudsakligen grundläggande, men har i sin tillämpning tydlig koppling och betydelse för hälsa och sjukdom hos såväl djur som människor. En närmare beskrivning finns på Forskning - Uppsala universitet

Projektbeskrivning: Luisa Hugerths forskargrupp önskar rekrytera en kandidat med stort intresse för forskning och som vill doktorera inom betydelsen av den orala mikrobiota för människohälsa och sjukdom. Vi önskar en mycket motiverad kandidat med förmåga att bedriva forskning inom parallella projekt som involverar både analys av ny sekvenseringsmaterial och meta-analyser. Vidare behöver kandidaten ha förmåga att bedriva forskningen självständigt och i samarbete med andra. Doktorandprojektet syftar till att öka förståelse kring de generella ekologiska mönster i den mänskliga orala mikrobiota och applicera denna kunskap på graviditetskomplikationer. De metoder som kommer att användas inkluderar (men är inte begränsade till) bioinformatisk annotering av metagenomisk data, tillämpning av ekologiska och epidemiologiska analyser, samt maskininlärning och andra prediktionsmodeller.

Arbetsuppgifter: Huvuduppgiften för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning vilket innefattar såväl deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan det även ingå undervisning och annat institutionsarbete, dock max 20% av arbetstiden.

Kvalifikationskrav

Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

• Avlagt examen på avancerad nivå inom immunologi, biomedicin, mikrobiologi eller liknande område, eller
• Fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
• på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper
• Dokumenterad kompetens inom R, python eller motsvarande, vilket kan intygas med t.ex. en github repo eller annan kod skrivit i forskningssyfte
• Praktiska kunskaper inom mikrobiotastudier, antingen med markörgener eller metagenomik
• Mycket goda kunskaper i talad och skriftlig engelska
• Förmåga att självständigt initiera, utföra och slutföra forskningsprojekt
• Kreativitet, flexibilitet, analysförmåga och förmåga att arbeta i grupp

Önskvärt/meriterande i övrigt 

• Praktisk erfarenhet av forskning inom mikrobiota är önskvärd
• Tidigare kunskap och erfarenhet med oral hälsa är högt meriterande

Urvalet baseras på följande kriterier: Fullgörande av ovanstående kvalifikationer, tidigare erfarenhet av arbete och forskning inom det bredare området som relaterar till det ovan beskrivna projektet, betyg i relevanta kurser, lämplighet av kurserna för forskningsprogrammet. En integrerad bedömning av sökanden genereras för att anställa den bästa möjliga kandidaten som kan lyckas med doktorandstudier och bidra till en positiv utveckling av forskningsprogrammet. Vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper, inklusive analytisk förmåga, noggrannhet, flexibilitet och samarbetsförmåga.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Luisa W. Hugerth, luisa.hugerth@imbim.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 3 december 2024, UFV-PA 2024/4029.