Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 500 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.igp.uu.se

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

SciLifeLab (www.scilifelab.se) är ett nav inom biovetenskaplig forskning i Sverige och ett forskningssamarbete mellan KTH, Karolinska Institutet, Stockholms universitet och Uppsala universitet, med ytterligare verksamhet på många stora lärosäten i landet. Samtliga verksamma inom SciLifeLab är anställda vid något av de samverkande lärosätena. SciLifeLab har från 2013 ett uppdrag från regeringen att verka som nationell infrastruktur för att tillgängliggöra spjutspetsteknologier och -expertis inom molekylära livsvetenskaper till forskare i Sverige samt utgöra ett internationellt ledande centrum för forskning inom områden som hälsa och miljö. SciLifeLab är också värd för den nya miljardsatsningen Data-Driven Life Science (DDLS) med elva partnerorganisationer.

Den anställde kommer att arbeta vid SciLifeLab Data Centre, som ansvarar för IT-frågor och forskningsdatahantering för SciLifeLabs teknologiplattformar och andra SciLifeLab-organiserade program och aktivititer, bl.a. det nya nationella forskningsprogrammet för datadriven livsvetenskap (DDLS). Vi har ett nationellt uppdrag och driver tjänster för livsvetenskapliga data och e-infrastruktur, men även frågor om FAIR, öppen vetenskap och datadriven forskning, i stark samverkan med nationella och internationella aktörer. Hos oss har du möjlighet att aktivt påverka hur IT integreras i framtidens hälso- och miljöforskning, och arbeta för öppenhet, reproducerbarhet och största möjliga vetenskapliga genomslag för de stora mängder forskningsdata som genereras i fältet. Du kommer att arbeta med forskare, dataingenjörer, data stewards, och systemutvecklare i ett snabbt växande, dynamiskt och progressivt team med en ledande roll i landet.

Arbetsuppgifter
SciLifeLab Data Centre söker motiverade och kunniga systemutvecklare. Vi kommer inom den nya nationella dataplattformen för SciLifeLab och DDLS-programmet bygga upp tjänster för serviceenheter och forskargrupper inom life science. Arbetet kommer att inbegripa både nyutveckling, existerande mjukvarukomponenter och kommersiella system. Du kommer att ha möjlighet att arbeta i agila utvecklingsprojekt för t.ex.
- System för forskningsdata från t.ex. genomik, proteomik, mikroskopi, och kemisk biologi, särskilt integration mot våra dataportaler för pandemiberedskap och data-driven livsvetenskap
- Tjänster för hantering av hälsodata i samverkan med aktörer inom sjukvården eller klinisk forskning
- System och verktyg för metadatahantering, t.ex. information om provberedning, experimentell bearbetning och produktion av mätdata
- Tjänster för distribuerade lagrings- och beräkningssystem kopplade till metadata för studier och prov
- Skapande av en helt ny teknisk plattform och stödsystem för utbildning/träning och kursmaterial enligt Open Science, i samarbete med SciLifeLab Training Hub

I uppgifterna ingår även utformning och testning av system tillsammans med användare och dataingenjörer. Du kommer att arbeta i ett team med forskare, ingenjörer, data stewards och systemutvecklare, mitt i SciLifeLabs nationella forskningsinfrastruktur. Arbetet inkluderar samarbeten mellan SciLifeLab och nationella centra för e-infrastruktur, t.ex. Berzelius vid Nationellt Superdatorcentrum i Linköping.

Kvalifikationskrav
Ansökande ska ha universitetsexamen i ämne med anknytning till tjänsten. Utöver detta krävs:
- Dokumenterad erfarenhet av relevanta programmeringsspråk, t ex Python 
- Dokumenterad erfarenhet av system för dokumentation och versionshantering med Git
- Dokumenterad erfarenhet av virtualisering och/eller container-baserade system och teknologier, gärna Kubernetes och Docker.
- Dokumenterad erfarenhet av att arbeta i Linuxbaserade miljöer
- Flytande engelska.
 Stor vikt kommer att läggas på personlig lämplighet.

Önskvärt/meriterande i övrigt
- Kunskap eller intresse av biomedicinsk forskning och infrastruktur.
- Erfarenhet av teknologier för t.ex. datalagring, metadatahantering, beräkning och visualisering
- Erfarenhet av system- och användaradministration för mjukvarutjänster eller beräknings- och lagringsresurser
- Erfarenhet av dataskydd och informationssäkerhetsarbete
- Erfarenhet av att arbeta agilt i projekt där DevOps är en viktig del
- Förmåga att arbeta både individuellt och i samarbete med kollegor i olika fält
- Intresse av utbildning inom livsvetenskaperna, samt Open Science och delning av utbildningsmaterial
- Driftighet, initiativförmåga och ett intresse av att stödja svensk forskning inom datadriven livsvetenskap.

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Johan Rung, johan.rung@scilifelab.uu.se


Välkommen med din ansökan senast den 28 april 2023, UFV-PA 2023/1178.

Anställningsform Tillsvidareanställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde snarast
Löneform Individuell lönesättning
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2023/1178
Facklig företrädare
  • Seko Universitetsklubben, seko@uadm.uu.se
  • ST/TCO, tco@fackorg.uu.se
  • Saco-rådet, saco@uadm.uu.se
Publicerat 2023-03-31
Sista ansökningsdag 2023-04-28

Tillbaka till lediga jobb