Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper

Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 300 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på www.medsci.uu.se.

Är du nyfiken på det snabbt växande området bioteknik? Vill du arbeta tillsammans med forskare och bioinformatiker i en dynamiskt och kreativ miljö vid en av Europas största verksamheter för DNA-analyser? Som systemadministratör vid SNP&SEQ-teknologiplattformen kommer du vara delaktig i att underhålla infrastrukturen som möjliggör flödet av storskalig genotypnings- och sekvenseringsdata från våra instrument till forskare.

SNP&SEQ-teknologiplattformen är en del av den Nationella Infrastrukturen för Genomik (NGI) vid SciLifeLab i Uppsala. SNP&SEQ erbjuder service med moderna storskaliga metoder och applikationer inom sekvensering (NGS), SNP-genotyping och proteomik till uppdragsgivare inom svensk akademi och industri, och även till internationella uppdragsgivare. Verksamheten består av en multidisciplinär grupp av forskare, projektkoordinatorer, forskningsingenjörer, bioinformatiker, systemutvecklare och systemadministratörer. Årligen genererar plattformen >300 terabaser av sekvensdata från >20 000 prover och levererar >25 miljarder genotyper från >30 000 prover till uppdragsgivarna. Mer om SNP&SEQ:s verksamhet finns att läsa på: https://snpseq.medsci.uu.se/

Vi söker nu en systemadministratör till vår systemgrupp som består av systemutvecklare och systemadministratörer. Systemgruppen jobbar med att upprätthålla en säker IT-miljö med hög tillgänglighet och underhåller, utvecklar och driftsätter verktyg för de laborativa och bioinformatiska processerna i verksamheten. Systemen inkluderar automatisering av datahantering, spårning av prover, steg och reagens i laboratorieflöden, dokumenthantering samt visualisering av nyckelindikatorer (KPI). SNP&SEQ växer och förändras snabbt vilket kräver en skalbar och dynamisk IT-miljö med en hög grad av automatisering. Den information som hanteras i verksamheten består delvis av känsliga personuppgifter. SNP&SEQ arbetar enligt den europeiska kvalitetsstandarden ISO/IEC 17025 och är ackrediterade av SWEDAC som ett testlaboratorium för genotypning och sekvensering. Arbetet vid SNP&SEQ utförs med fokus på att tillhandahålla service av högsta möjliga kvalitet.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Arbetsuppgifter
Vår infrastruktur består till huvuddelen av Linux-servrar (Redhat- och Debian-baserade system) virtualiserade i en VMWare-miljö och orkestrerade via Ansible-playbooks. Verksamheten har även ett antal system som administreras av UPPMAX (Linuxsystem) och Uppsala universitets IT-avdelning (Windowssystem). I arbetsuppgifterna ingår:

  • Linux systemadministration
  • Windows systemadministration
  • Administration och support av:
    • Fysiska och virtuella servrar (VMWare/Hyper-V)
    • Nätverk, brandväggar, switchar, routrar etc
    • MS-SQL databasservrar
  • Inköp och licenshantering
  • Upprätthålla kontakten med Uppsala Universitets IT-organisation och beställning av tjänster därifrån
  • Livscykelhantering av IT-relaterade produkter, inklusive dokumentation
  • Backup & arkivering, relaterade noder (IBM spectrum protect)
  • Active Directory
  • Två-faktorautentisering via olika tjänster
  • Ärendehantering och dokumentation i Jira och Confluence
  • Skapa skript för att automatisera tidskrävande uppgifter i verksamhetens olika delar
  • Systemövervakning
  • Användarsupport

Eftersom verksamheten vid SNP&SEQ är ackrediterad av SWEDAC enligt kvalitetsstandard ISO17025, läggs det stor vikt vid spårbarhet, dokumentation och versionskontroll.

Kvalifikationskrav
Vi söker dig som har goda kunskaper i och minst 2 års dokumenterad arbetslivserfarenhet av:

  • Administration av Linux server
  • Administration av Windows server
  • Att skriva dokumentation för användare med olika teknisk bakgrund
  • Nätverk, TCP/IP och brandväggar
  • Muntlig och skriftlig kommunikation på engelska

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Som person ska du ha en positiv attityd och en vilja att lära och vidareutvecklas. Du är ansvarstagande, har känsla för detaljer och tycker att bra dokumentation är viktigt. Du ska också kunna arbeta såväl självständigt som i grupp, samt ha förmåga att ta initiativ och driva problemlösning och förbättringsarbete.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Utöver de kvalifikationskrav som listas ovan ser vi gärna tidigare erfarenhet eller intresse från eller flera av följande områden:

  • Enklare systemutveckling,tex i skriptspråken Python eller Powershell
  • Arbete med virtualiserade miljöer
  • Arbete med AD
  • Infrastruktur-automatisering och skriptning med t.ex. Ansible
  • Systemövervakning
  • Kvalitetssäkrat arbete, tex enligt ISO 27001 eller ISO 9001
  • Versionshanteringssystem, t.ex. Git
  • Informationssäkerhet och hantering av känsliga data
  • Molekylärbiologi, bioinformatik, statistik, genetik, biologi eller liknande
  • Goda kunskaper i svenska i tal och skrift

Om anställningen 
Anställningen är 2 år. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Gruppchef  Kristina Larsson, 070-1679451, kristina.larsson@medsci.uu.se eller systemadministratör Stephan Lohse, tel 072-9999196, Stephan.Lohse@medsci.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 17 juni 2022, UFV-PA 2022/1829.

Anställningsform Tillsvidareanställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Enligt överenskommelse
Löneform Individuell lönesättning
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100 %
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2022/1829
Facklig företrädare
  • Seko Universitetsklubben, seko@uadm.uu.se
  • ST/TCO, tco@fackorg.uu.se
  • Saco-rådet, saco@uadm.uu.se
Publicerat 2022-05-13
Sista ansökningsdag 2022-06-17

Tillbaka till lediga jobb