Doktorand i svampgenomik

Vill du arbeta med systematisk biologi, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som Postdoktor på Uppsala universitet.

Forskning i laboratoriet Fungal Accessory Genome Evolution (FungAGE) fokuserar på att förstå evolutionen av genomer och den genetiska grunden för anpassning hos svampar. Vi upptäckte nyligen att många svampar bär på massiva transposonerbara element, kallade Starships, som mobiliserar en stor mångfald av svampgener. Många av dessa element bär på toxin-/motgiftgener som kan påverka Starships spridning. Huvudmålet med denna doktorandtjänst är att avgöra om Starships i den mänskliga svamppatogenen Aspergillus fumigatus bär på aktiva toxin-/motgiftgener, och vilket inflytande dessa gener kan ha på populationsstrukturen och dynamiken hos denna viktiga patogen.

Arbetsuppgifter
Doktoranden förväntas till stor del arbeta i våtlaboratoriet. Fokus kommer att ligga på genetiska manipulationer av svampen Aspergillus fumigatus. Detta kommer även att inkludera vektorkonstruktion med hjälp av jäst- och/eller bakterietransformationer. Metoder kan också innefatta CRISPR/Cas9. Doktoranden förväntas också analysera data som de genereras, inklusive mindre bioinformatiskt arbete. Doktoranden förväntas kommunicera resultat både på internationella konferenser och genom att skriva vetenskapliga artiklar för publicering.

Kvalifikationskrav
Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

• avlagt examen på avancerad nivå inom mikrobiologi, molekylärbiologi, evolutionsbiologi eller annan relevant ämne, eller
• fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
• på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Erfarenhet av molekylära tekniker är ett krav. Goda muntliga och skriftliga kunskaper i engelska är ett krav.

Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet så som god problemlösningsförmåga, kommunikation- och samarbetsförmåga.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av att analysera genomiska data och mikrobiell odling, särskilt av svampar, är meriterande. Tidigare erfarenhet av Aspergillus fumigatus är önskvärt. Erfarenhet av kommunikation av vetenskapliga koncept inom en akademisk miljö, inklusive att formulera hypoteser och genomföra statistiska analyser är också meriterande.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Aaron Vogan, aaron.vogan@ebc.uu.se

I denna rekrytering har vi ersatt det personliga brevet med frågor som du besvarar i samband med din ansökan. Svaren kommer att användas som en del i urvalsprocessen.

Välkommen med din ansökan senast den 23 december 2025, UFV-PA 2025/3515.