Doktorand i kausal maskininlärning inom precisionsmedicin

Vill du utveckla nya maskininlärningsmetoder för precisionsmedicin och kliniskt beslutstöd för bröstcancerdiagnostik och -behandling, tillsammans med kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som doktorand vid Institutionen för informationsteknologi, Uppsala universitet.

Institutionen för informationsteknologi har en ledande position inom såväl forskning som utbildning på alla nivåer. Vi är idag Uppsala universitets tredje största institution och har i dag drygt 350 anställda varav 120 lärare och 120 doktorander. C:a 5000 grundutbildningsstudenter läser en eller flera kurser vid institutionen varje år. Mer information om oss hittar du på institutionens webbplats.

Vid avdelningen för Systemteknik utvecklar vi både teori och konkreta verktyg för att designa system som lär sig, resonerar och agerar i den verkliga världen baserat på en sömlös kombination av data, matematiska modeller och algoritmer. Vår forskning integrerar expertis från maskininlärning, optimering, reglerteori och tillämpad matematik, och spänner över olika tillämpningsområden som medicin, energisystem, biomedicinska system, materialvetenskap och säkerhet. Vi har ett brett nätverk av starka internationella samarbetspartners över hela världen, och strävar efter att alla doktorander ska få en gedigen internationell erfarenhet under sin doktorandtid.

Tjänsten finansieras av Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, WASP, som är Sveriges största enskilda forskningsprogram i modern tid. Programmet skapar en plattform för akademisk forskning och utbildning i nära samarbete med ledande svensk teknikintensiv industri. Forskningen innefattar artificiell intelligens och autonoma system som verkar i samarbete med människor och som anpassar sig till sin omgivning med hjälp av sensorer, information och kunskap och skapar intelligenta system av system. WASPs vision är excellent forskning och kompetens inom artificiell intelligens, autonoma system och mjukvara till gagn för Sveriges industri och samhälle.

Projektbeskrivning
Detta doktorandprojekt är en del av det tvärvetenskapliga WASP-DDLS NEST-projektet AID4BC, vars övergripande mål är att utveckla datadrivna multimodala metoder för att möjliggöra verklig precisionsdiagnostik genom hela bröstcancerförloppet. AID4BC:s partnerkonstellation, belägna på fyra ledande platser i Sverige, är sannolikt den enda globala konstellationen som har tillgång till stora (>10 000 patienter) matchade multimodala data inom radiologi, patologi och molekylär profilering samt kliniska data.

Maskininlärningsmetoder har stor potential att främja precisionsmedicin och kliniskt beslutsstöd för diagnostik och behandling av bröstcancer. Samtidigt presenterar dessa tillämpningsområden nya utmaningar för statistisk inlärningsmetodik. De innefattar viktiga beslut med kritiska avvägningar och osäkerheter. De utmanas också av själva datainsamlingsprocessen som ger upphov till förskjutningar mellan fördelningarna över tidigare och framtida data.

Detta projekt fokuserar på forskning om teori och metoder som kan hantera dessa nya utmaningar och motiveras av behovet av att utveckla maskininlärningsmetoder som tar hänsyn till orsakssamband. Målet är att utveckla nya idéer och metoder som kan hantera osäkerheterna och tydliggöra relevanta kliniska avvägningar inom både prediktiva och preskriptiva datadrivna metoder.

Kandidaten förväntas samarbeta i stor utsträckning med kliniska experter på de andra platserna inom AID4BC-projektet, samt med kliniska partners vid Uppsala Akademiska sjukhus, med det yttersta målet att förbättra patienternas hälsoutfall. Detaljerna i projektet kommer att bestämmas i en dialog mellan studenten och handledaren.

Arbetsuppgifter 
Doktoranden kommer främst att ägna sig åt den egna forskarutbildningen. Övrig tjänstgöring vid institutionen, som avser undervisning och administrativt arbete, kan ingå inom ramen för anställningen (max 20%).

Kvalifikationskrav 
Behörighet till utbildning på forskarnivå regleras i Högskoleförordningen. Grundläggande behörighet har den som:

• avlagt examen på avancerad nivå inom teknisk fysik, elektroteknik, maskinlärning, data science, matematisk statistisk, tillämpad matematik eller ett liknande område, eller
• fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
• på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Vi söker kandidater med:

• en solid matematisk grund och ett intresse för statistisk inlärning,
• ett intresse för interdisciplinlärt samarbete och till att överföra nya metoder till kliniska tillämpningar,
• god kommunikationsförmåga med tillräckliga kunskaper i muntlig och skriftlig engelska,
• utmärkta studieresultat,
• god erfarenhet av programmering (gärna i Python),
• personliga egenskaper, såsom en hög nivå av kreativitet, noggrannhet och/eller ett strukturerat tillvägagångssätt för problemlösning är avgörande.

Högskolan får för en enskild sökande medge undantag från kravet på grundläggande behörighet, om det finns särskilda skäl. (7 kap. 39 § HF). För särskild behörighet, se studieplanen för ämnet.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet och kurser i ett eller flera ämnen värdesätts: estimeringsteori, statistisk maskininlärning, optimering, signalbehandling, systemidentifiering och reglerteknik.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer.

Ansökan
Ansökan ska innehålla:

1. Ett personligt brev (max 2 sidor), på engelska, som kortfattat beskriver din motivation för att söka denna tjänst och en självbedömning av varför du skulle vara rätt kandidat. Brevet ska också ange tidigast möjliga anställningsdatum.
2. Ett curriculum vitae (CV).
3. En kopia av relevanta betygshandlingar (översatta till svenska eller engelska).
4. Masteruppsatsen (eller ett utkast till denna, och/eller annan egenproducerad teknisk eller vetenskaplig text), publikationer och andra relevanta dokument.
5. Kontaktuppgifter till två referenser (namn, e-postadresser och telefonnummer) och upp till två rekommendationsbrev.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde 12 januari 2026 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Dave Zachariah (dave.zachariah@it.uu.se) eller Jens Sjölund (jens.sjolund@it.uu.se).

Välkommen med din ansökan senast den 3 oktober 2025, UFV-PA 2025/2618.