Bioinformatiker

Bioinformatiker

Vill du arbeta med bioinformatik, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som bioinformatiker på Uppsala universitet.

National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS), https://nbis.se, främjar livsvetenskaplig forskning i Sverige genom att erbjuda expertstöd och utveckla avancerad bioinformatikinfrastruktur. Som en nationell satsning sysselsätter NBIS mer än 120 bioinformatiker, systemutvecklare och datahanteringsexperter på flera lärosäten i Sverige. NBIS utgör också bioinformatikplattformen på SciLifeLab, en nationell resurs som möjliggör forskning inom molekylära biosciences genom att tillhandahålla toppmoderna teknologier och teknisk expertis. Med starka band till datagenererande faciliteter och pågående samarbeten med ledande forskargrupper har NBIS enastående möjligheter att erbjuda bioinformatiska analyser av högsta klass. NBIS utgör också den svenska noden i ELIXIR, den europeiska infrastrukturen för biologisk information.

NBIS söker nu en erfaren bioinformatiker för att stödja svenska forskningsprojekt. Som en del av vårt dynamiska team kommer du att arbeta nära forskare för att analysera storskaliga biologiska data och bidra till att utveckla vår infrastruktur för bioinformatik. God problemlösningsförmåga, noggrannhet och kommunikationsförmåga är viktiga egenskaper i denna roll. Flexibilitet och en vilja att lära sig är också viktigt, eftersom NBIS forskningsstöd kontinuerligt behöver anpassas till aktuella behov inom det svenska forskarsamhället.

Tjänsten är placerad vid Uppsala universitet på ICM (Institutionen för Cell- och molekylärbiologi), inom den kreativa miljön vid SciLifeLab Uppsala-noden, "The Hub", där över 50 NBIS-bioinformatiker, utvecklare och datahanteringsexperter arbetar tillsammans med andra SciLifeLab-faciliteter och forskargrupper. Hos NBIS kommer du att vara en del av ett team, med goda möjligheter att bolla idéer, lära sig av kollegor och växa i din yrkesroll genom interna kurser och spännande projekt.

Arbetsuppgifter 
Dina arbetsuppgifter omfattar framförallt praktiskt arbete med bioinformatik och utveckling i olika typer av forskningsprojekt. Tjänsten är placerad i NBIS ”Evolution och Biodiversitet”-team och analyser typiska för det forskningsområdet kan ingå, men även andra typer av analyser.  Mycket god teknisk kompetens och förmåga att anpassa sig till nya områden är därför av vikt för den här tjänsten. Du kommer framförallt jobba i projekt vetenskapligt rankade i en ”peer-review”-process, men andra typer av projekt kan ingå. Arbetsuppgifter innefattar, men är inte begränsade till, utveckling av pipelines i Nextflow eller Snakemake, utveckling av skript i Python och/eller R, och körning av storskaliga analyser i HPC-miljöer. Arbetet kommer innebära höga krav på reproducerbarhet och erfarenhet av verktyg som möjliggör reproducerbarhet såsom Git och ”containers” är därför av vikt. NBIS har också en stor kurskatalog och du kommer ha möjlighet att undervisa på avancerad nivå (doktorandnivå och uppåt).

Kvalifikationskrav

• Doktorsexamen i bioinformatik, beräkningsbiologi, datavetenskap eller ett relaterat område.
• 5+ års dokumenterad erfarenhet av att jobba praktiskt med sekvensbaserad bioinformatik, inklusive mycket god kunskap om vanligt förekommande verktyg.
• Erfarenhet av skriptning i Python (eller motsvarande), inklusive förmåga att planera, skriva och dokumentera skräddarsydda skript. Länk till ett kodarkiv (t.ex. GitHub eller GitLab) med exempel på egenutvecklade skript måste bifogas i CV.
• Erfarenhet av att arbeta i Unix/Linux-miljöer och med högpresterande datorsystem (HPC) (t.ex. SLURM etc.).
• Mycket god kommunikationsförmåga i både skrift och tal på engelska, samt förmåga att samarbeta med forskare från olika bakgrunder.
• Betydelse kommer att läggas vid personlig lämplighet för tjänsten, som förmåga att driva projekt och arbeta i en samarbetsinriktad, men serviceinriktad miljö.
• En vilja att lära sig nya metoder och förmåga att skaffa sig nya färdigheter är ett krav för denna tjänst.

Önskvärt/meriterande i övrigt

• Erfarenhet av verktyg och teknologier som främjar reproducerbarhet, såsom containrar (t.ex. Docker, Singularity).
• God förståelse för vanliga bioinformatikdataformat och arbetsflöden.
• Erfarenhet av arbete inom forskningsområdet Evolution och Biodiversitet är positivt.
• Erfarenhet av utveckling av pipelines i Nextflow eller Snakemake.
• Tidigare erfarenhet av att arbeta i en supportfunktion är också fördelaktigt.

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde snarast eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala. Uppsala universitet tillämpar inte distansavtal, vilket innebär att arbete på plats är ett krav. 

Upplysningar om anställningen lämnas av: Chef Henrik Lantz, henrik.lantz@nbis.se

Välkommen med din ansökan senast den 18 augusti 2025, UFV-PA 2025/2130.