Postdoktor i komparativ genomik

Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med personal och studenter från hela världen. Vår forskning omfattar allt från evolutionär ekologi och genetik till studier av ekosystem. Se vidare Institutionen för ekologi och genetik - Uppsala universitet

Vi söker nu en postdoktor i komparativ genomik till programmet för Växtekologi och evolution.

Projektbeskrivning
Denna tjänst ingår i EU:s Horizon-projekt FruitDiv, som syftar till att övervaka, karakterisera, utnyttja och bevara mångfalden hos vilda släktingar till fruktträd (CWR). Projektet fokuserar särskilt på fem arter: äpplen, päron, plommon, mandlar och körsbär. Ett av projektets mål är att ge en jämförande bild av den genetiska mångfalden och populationsstrukturen hos CWR-arter. För detta ändamål har vi nyligen erhållit helgenomsekvenseringsdata (Illumina short-read pair-end) för över 250 individer av varje art som samlats in i naturliga populationer över deras utbredningsområden. Vi söker en postdoktorand som kan använda dessa data för att göra jämförande demografiska slutsatser för att i) förstå och jämföra CWR-arters demografiska historia, samt effekten av domesticering på dem, och ii) undersöka mönster av introgression mellan grödor och CWR. Projektet kommer främst att använda SNP, men vidare utveckling kan innefatta undersökning av strukturella variationer. Projektet leds gemensamt av Martin Lascoux och Pascal Milesi.

Arbetsuppgifter
Postdoktoranden kommer att analysera helgenomsekvenseringsdata från fem fruktträdsarter i ett jämförande sammanhang. Arbetets huvudsakliga innehåll kommer att bestå av populations- och kvantitativa genomikanalyser. Även om projektet i första hand är datorbaserat kan det även innefatta en mindre del fältarbete och/eller laboratoriearbete.

Kvalifikationskrav
Doktorsexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom Evolutionär biologi, populations- eller kvantitativ genomik eller relaterade områden. Examen ska vara uppfylld senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc. Den sökande ska ha tidigare erfarenhet av att arbeta med stora genomiska datamängder, både vad gäller antalet prover och antalet analyserade varianter.

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom initiativförmåga, kreativt tänkande, förmåga att samarbeta och engagera sig i forskningsgruppernas och institutets verksamhet. Kandidaten ska ha mycket god förmåga att uttrycka sig på engelska i såväl tal som i skrift.

Meriterande
Den sökande bör ha goda kunskaper om de grundläggande principerna inom evolutionsbiologi och en bakgrund inom populationsgenetik och genomisk, särskilt inom demografiska slutsatser. Dessutom bör den sökande ha en gedigen grund inom statistik. Följande färdigheter att ses även som meriterande: programmering, bioinformatik, matematik/modellering/statistik. Intresse för strukturell variantidentifiering är också en fördel. Observera att en bakgrund inom växtbiologi inte är obligatorisk, men ses som en fördel.

Om anställningen
Tidsbegränsad anställning i 24 månader, med möjlighet till förlängning upp till max 36 månader, enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 2026-01-12 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av
Universitetslektor, Pascal Milesi, pascal.milesi@ebc.uu.se

Professor, Martin Lascoux, martin.lascoux@ebc.uu.se

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska innehålla 1) ett brev där du beskriver dig själv, dina forskningsintressen och varför du är intresserad av tjänsten, 2) ditt CV, inklusive namn och kontaktuppgifter till minst två referenser (e-postadresser och telefonnummer) och 3) en lista över relevanta publikationer. Ansökan bör skrivas på engelska.

Välkommen med din ansökan senast den 01 December 2025. UFV-PA 2025/3194