Bioinformatiker med möjlighet att forska - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för kirurgiska vetenskaper (IKV) tillhör vetenskapsområdet för medicin och farmaci och har ca 160 anställda och runt 200 registrerade doktorander, av vilka flertalet är kliniskt verksamma läkare och sjuksköterskor. Vid institutionen bedrivs forskning och undervisning på grundnivå, avancerad nivå och forskarnivå. Undervisningen sker bl.a. inom läkar-, sjuksköterske-, röntgensjuksköterske- och specialistsjuksköterskeprogrammen. Forskningen bedrivs i forskargrupper organiserade utifrån olika kirurgiska specialiteter och näraliggande ämnen såsom anestesi, intensivvård och radiologi. Mycket forskning bedrivs i samarbete mellan olika forskargrupper inom IKV och vid andra institutioner vid Uppsala universitet samt med andra universitet både i Sverige och internationellt. Många av institutionens anställda har anställningar som är förenade med befattningar vid Akademiska sjukhuset.

Nu söker forskargruppen för anestesi och intensivvård en forskare i bioinformatik med intresse för epidemiologi!

Projektbeskrivning
Utveckling av svår sjukdom på grund av infektioner är starkt kopplad till värdfaktorer. Det finns idag stora genotypade kohorter liksom stora databaser med data på hälsa och sjukdom. Genom att använda data från stora kohorter och nationella register studerar vi vilka biologiska mekanismer som ligger bakom allvarlig sjukdom.

Arbetsuppgifter
I rollen som bioinformatiker får du möjlighet att arbeta med ovanstående projekt. Det gör du genom att driva forskningsprojekt och hantera stora databaser med genetiska data och data från nationella register. Du ska undersöka vilka genvarianter och proteiner som är nyckelfaktorer för att utveckla allvarlig sjukdom, till exempel efter infektion, med metoder som GWAS och Mendelisk randomisering. Vidare består arbetsuppgifterna av självständig databearbetning, statistiska analyser och att skriva vetenskapliga artiklar i samarbete med forskningsgruppen.

Kvalifikationskrav

• Doktorsexamen i bioinformatik eller epidemiologi.
• Dokumenterade färdigheter i data management, statistiska analyser och statistisk modellering(R, Python).
• Erfarenhet av genetisk epidemiologi och mycket goda kunskaper i genetisk epidemiologisk studiedesign.
• Tidigare kunskap och erfarenhet av att självständigt programmera statistiska analyser av genetiska och epidemiologiska data.
• Mycket goda kunskaper i det engelska språket, både muntligt och skriftligt, samt utmärkta färdigheter i vetenskaplig skrift.

Som person har du en fallenhet för att samarbeta med andra, vilket är nödvändigt för ett framgångsrikt arbete med andra såväl som individuellt. Du har lätt för att prioritera bland dina arbetsuppgifter och du har en god organisationsförmåga. Slutligen är du detaljorienterad och har ett professionellt förhållningssätt. Stor vikt kommer att fästas vid personliga egenskaper.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av arbete med data från biobankerna UK Biobank och Epihealth, samt svenska kvalitetsregister så som Svenska Intensivvårdsregistret (SIR) och Patientregistret, samt erfarenhet av arbete i Uppsala universitets datasystem för känsliga data (Bianca) är meriterande. Erfarenhet av statistiska analyser av data från svenska nationella register anses också meriterande för anställningen.

Om anställningen
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde 20.11.2024 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

I denna rekrytering har vi ersatt det personliga brevet med frågor som du besvarar i samband med din ansökan. Svaren kommer att användas som en del i urvalsprocessen.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Prof. Miklos Lipcsey, miklos.lipcsey@uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 15 oktober 2024, UFV-PA 2024/3345