Doktorand i molekylär evolution - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vi är lokaliserade till Biomedicinskt Centrum (BMC) i Uppsala (http://www.bmc.uu.se) som också inrymmer Uppsala-noden för Science for Life Laboratory (http://www.scilifelab.se), en nationell infrastruktur som tillhandahåller teknikplattformar inom genomik, bioinformatik och relaterade områden inom livsvetenskaperna.

Institutionen för Cell och Molekylärbiologi vid Uppsala universitet är en tvärvetenskaplig och framgångsrik forskningsinstitution som bedriver forskning inom strukturbiologi, mikrobiologi, bioinformatik och molekylär evolution (http://www.icm.uu.se). Vår forskargrupp arbetar inom avdelningen för molekylär evolution. Vi studerar hur arvsmassan förändras över tiden med hjälp av bioinformatiska analyser av storskalig genomisk data från mikroorganismer. Kunskapen är viktig för att förstå livets tidiga utveckling liksom även hur mikroorganismer anpassar sig till högre organismer och varför vissa bakterier blir patogener medan andra samverkar med och är till nytta för sina respektive värdorganismer.

Arbetsuppgifter/Projektbeskrivning: Det övergripande målet för detta doktorandprojekt är att studera evolutionen av mikrobiella samhällen med hjälp av bioinformatiska metoder. Som modellsystem använder vi mjölksyrabakterier som isolerats från honungsmagarna hos honungsbin. Studierna kommer att baseras på data om genomen, transkriptomen och proteomen från hundratals mjölksyrabakterier isolerade från binas honungsmagar och andra ställen i bikuporna. I projektet kommer vi att försöka förstå hur bakterierna samverkar, både med varandra och med andra mikroorganismer i bikupan liksom även med bina. Arbetet kommer att utföras med hjälp av de senaste teknikerna inom bioinformatik och särskilt intressanta gener kommer sedan att undersökas med avseende på funktion, stabilitet och struktur. Det långsiktiga målet är att utveckla en modell på ekosystemnivå över samverkan och konkurrens i mikrobiella samhällen.

Institutionstjänstgöring, vanligtvis undervisning, kan komma att ingå i tjänsten, men omfatta högst 20% omfattning av tjänsten  (För mer information om utbildning på forskarnivå finns på teknisk naturvetenskaplig fakultets hemsida http://teknat.uu.se.)

Kvalifikationskrav: Den sökande ska ha en masterexamen i biologi eller kvalifikationer med inriktning mot bioinformatik, mikrobiologi eller annat ämne som arbetsgivaren bedömer som likvärdigt. Den sökande ska ha god förmåga att arbeta självständigt såväl som i grupp. Vidare är goda skriftliga och muntliga kunskaper i engelska en förutsättning för tjänsten, då arbetet sker i en internationell miljö.

Önskvärt/meriterande i övrigt: Tidigare erfarenheter bioinformatiska analyser av sekvensdata är meriterande, liksom tidigare erfarenhet av projektarbete.

Uppsala universitet rekryterar personer som med avseende på den övergripande utvärderingen av kompetens, skicklighet och dokumenterade kvalifikationer, bedöms vara bäst lämpade att utföra och utveckla arbetet och som dessutom bidrar till en positiv utveckling av institutionen.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/.

Ansökan: Ansökan ska innehålla en kort beskrivning av dina forskningsintressen och relevanta erfarenheter (maximum en sida), CV, kopior av examensbevis och betyg, examensarbete (eller utkast därav) och övriga handlingar som sökanden önskar åberopa (gärna dokumentation av tidigare bioinformatisk verksamhet). Vi ser också gärna att du lämnar uppgift om referenspersoner eller bifogar rekommendationsbrev från tidigare forskningshandledare.

Lön: Enligt lokalt kollektivavtal för doktorander.

Tillträde: Snarast eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning enl HF 5 kap § 7.

Anställningens omfattning: 100 %.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Siv Andersson, e-post: siv.andersson@icm.uu.se tel. 018-471 43 79.

Välkommen med din ansökan senast den 18 februari 2021, UFV-PA 2021/281.