Doktorand i medicinsk genetik för tidig upptäckt av äggstockscancer - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 500 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.igp.uu.se

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet. 

Arbetsuppgifter
Doktorandprojektet syftar till att kartlägga möjligheter att använda självtagna prover för tidig upptäckt/screening av äggstockscancer. Projektet använder storskalig analys av tex DNA, RNA och proteiner i dels tumörvävnad och plasma, dels självprovtagen vaginalvätska och torkat kapillärt blod för att leta efter kombinationer av biomarkörer med goda prediktiva egenskaper.

Doktoranden kommer i första hand arbetat med datorbaserade analyser, tex maskininlärning/AI, av multipla typer av storskaliga biologiska data (multi-omics) med syfte att hitta robusta signaler för tidig upptäckt av gynekologisk cancer, främst äggstockscancer. Doktoranden kommer även att i sina doktorandstudier att fördjupa sig inom det relevanta ämnesområdet. Övriga arbetsuppgifter inkluderar att skriva forskningsartiklar om sina resultat och publicera dem i vetenskapliga tidskrifter samt presentera sin forskning på relevanta internationella konferenser. Andra uppgifter vid institutionen, exempelvis administration och undervisning kan inkluderas till en nivå ej överstigande 20% av arbetstiden.

Ytterligare information om forskargruppen finns att tillgå på websidan: www.igp.uu.se/research/genomics-neurobiology/ulf-gyllensten/more-info/

Kvalifikationskrav
Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

• avlagt examen på avancerad nivå inom bioinformatik eller bioteknologi, eller annat ämne som arbetsgivaren bedömer som likvärdigt
• fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Den sökande ska kunna arbeta självständigt men även fungera bra i grupp. Vidare bör den sökande vara mycket motiverad, noggrann och målinriktad. Sökande ska kunna uttrycka sig väl på engelska, både muntligt och i skrift. Dokumenterad erfarenhet av statistik och bioinformatiska analyser. Dokumenterad erfarenhet av analys av maskinnära sekvenseringsdata.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Tidigare forskningserfarenhet av eller intresse för maskininlärning, storskaliga data och bioinformatik är önskvärt. Av relevans är också tidigare erfarenhet av cancerforskning, framför allt med avseende på tidig upptäckt/screening, bearbetning av stora datamängder, och/eller kunskaper inom linux/unix, programmering med Python och/eller R, bioinformatik eller biostatistik. Att kunna svenska är en fördel. Laborativ erfarenhet är en fördel, särskilt inom protein/DNA-extraktion och bibliotekspreparation. Särskild vikt kommer att läggas vid individuell lämplighet, vad gäller vem som bedöms ha de bästa förutsättningarna att bidra till det planerade projektet.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer. 

Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver dig själv, ditt forskningsintresse, dina erfarenheter samt varför du är intresserad av doktorandtjänsten (max 1 sida). CV innehållande utbildning och andra meriter, lista på publikationer, samt beskrivning av relevanta kunskaper utifrån kvalifikationerna. Bifoga också vidimerade kopior på examensbevis. Kontaktinformation till två referenspersoner och/eller rekommendationsbrev från tidigare handledare.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Stefan Enroth, stefan.enroth@igp.uu.se 

Välkommen med din ansökan senast den 12 maj 2023, UFV-PA 2023/933.