Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper

Systemutvecklare till NGI-Uppsala SNP&SEQ-teknologiplattformen vid Institutionen för medicinska vetenskaper.

Som en del av den nationella infrastrukturen för genomik (National Genomics Infrastructure, NGI) vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab, http://www.scilifelab.se), erbjuder SNP&SEQ-teknologiplattformen SNP-genotypning och nästa generationens sekvenseringsteknologi (Next Generation Sequencing, NGS) som service åt forskare i Sverige och andra länder (http://www.sequencing.se).

Arbetsuppgifter:
Vill du jobba inom ett av världens snabbast växande teknikområden? Vill du arbeta jämsides forskare och bioinformatiker i en dynamisk och kreativ atmosfär vid ett av Europas största sekvenseringscenter? Som systemutvecklare vid SNP&SEQ-faciliteten är du med och tar fram lösningar för att optimera flödet av data från våra sekvenseringsinstrument till svenska forskare. 

Dina främsta arbetsuppgifter är utveckling, driftsättning och underhåll av de system som används vid hanteringen av sekvensdata. Stort fokus i datahanteringen ligger på automatisering och informationssäkerhet.

Exempel på arbetsuppgifter:

  • Utveckling av open-source system som bearbetar och analyserar data i petabyte-klassen

  • Skapa smarta integrationer till vårt LIMS (Laboratory Information Management System)

  • Utveckla våra befintliga DevOps-lösningar som bygger på t.ex. Ansible, GitLab och TravisCI

  • Upprätta och validera dokumentation av system

Utveckling inom plattformen sker främst i Python. Då delar av verksamheten är ackrediterad av SWEDAC ställs höga krav på dokumentation och versionshantering.

Kvalifikationskrav:

  • Universitets- eller högskoleexamen med inriktning mot IT och systemutveckling, eller motsvarande

  • Minst 2 års dokumenterad erfarenhet av systemutveckling

  • Mycket god programmeringsvana, t.ex. i Scala, Java, Perl, Python eller liknande. Det är dock viktigare att du snabbt kan lära dig något nytt än vad du för tillfället behärskar

  • Vana av versionshantering

  • Kunskap om systemadministration av Unix- eller Linuxmiljöer

  • Mycket goda muntliga och skriftliga kunskaper i engelska

Vi söker en person med initiativförmåga, noggrannhet, ansvarskänsla samt god förmåga till både självständigt arbete och arbete i grupp. Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper, såsom positiv attityd och god samarbetsförmåga.

Önskvärt eller meriterande i övrigt:

  • Erfarenhet av arbete med datorkluster och distribuerade system

  • Erfarenhet av informationssäkerhetsarbete och kvalitetssäkring

  • Kunskap om molekylärbiologi och sekvenseringsteknologier

  • Kunskaper i svenska

Lön: Individuell lönesättning tillämpas

Tillträde: Snarast

Anställningsform: Tillsvidareanställning, provanställning 6 månader

Anställningens omfattning: 100%

Upplysningar om anställningen lämnas av: Pontus Larsson, pontus.larsson@medsci.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 20 mars 2018, UFV-PA 2018/93.

Anställningsform Tillsvidareanställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Snarast
Löneform Fast lön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad Heltid
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2018/96
Facklig företrädare
  • Ellena Papaioannou, Seko, 018-471 3315
  • Suzanne Borén Andersson, TCO/ST, 018-471 6251
  • Per Sundman, Saco-rådet, 018-471 1485
Publicerat 2018-02-19
Sista ansökningsdag 2018-03-20

Tillbaka till lediga jobb