Forskningsingenjör Clinical Genomics Uppsala

Vill du göra skillnad för patienter med cancer?
Vi söker en forskningsingenjör för att utveckla nya metoder och analysera prover med målet att etablera ny avancerad genetisk diagnostik för sjukvården. Tjänsten är tidsbegränsad med möjlighet till förlängning.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och det teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi

Clinical Genomics Uppsala är sedan starten 2013 en del av plattformen Clinical Genomics inom Science for Life Laboratory. Den bioinformatiska verksamheten är förlagd till Uppsala universitet, medan laboratoriearbetet utförs vid kliniska laboratorier på Uppsala Akademiska Sjukhus. Enhetens uppdrag är att bedriva service och utveckling för kliniknära forskning, samt att ta fram och tillhandahålla kliniska test, främst med hjälp av storskalig DNA-sekvensering, s.k. next-generation sequencing (NGS). I multidisciplinära team med bioinformatiker, molekylärbiologer och läkare levererar faciliteten kliniska bedömningar av upptäckta genetiska varianter. Verksamheten är framför allt inriktad mot ärftliga sjukdomar, olika former av cancer och mikrobiologi. För närvarande analyseras över 8000 humana kliniska prover per år med de metoder som faciliteten tillhandahåller. Eftersom genetisk diagnostik efterfrågas inom allt fler kliniska discipliner pekar prognosen på en stark tillväxt.

Arbetsuppgifter:
Faciliteten söker en forskningsingenjör på heltid för att analysera cancerprover med avancerade molekylärgenetiska tekniker. Tjänsten innehåller också viss utveckling och metodoptimering. Arbetet kommer till stor del vara fokuserat på att optimera och utföra pre-analytiska steg, såsom cellsortering, snittning av FFPE-klossar och extraktion av DNA och RNA, samt bibliotekspreparation för analyser inom cancer med hjälp av NGS. Förutom NGS kan även andra metoder, såsom digital-PCR, superRCA och single-cell-tekniker ingå. Tjänsten inkluderar experimentdesign, laborativt arbete och rapportering av uppdrag. Delaktighet i kvalitetsarbete, projektkoordination, utbildning och utveckling av verksamheten ingår också i arbetsuppgifterna.
De anställda kommer att jobba tillsammans med biomedicinska analytiker, bioinformatiker, läkare, sjukhusgenetiker och molekylärbiologer inom vår facilitet och även i nationella och internationella samarbeten.

Kvalifikationskrav:
- Mastersexamen eller liknande med biomedicinsk inriktning, såsom molekylärbiolog, BMA, biomedicinare eller bioteknolog. 
Utöver detta krävs:
- Stor erfarenhet av molekylärbiologiska metoder. 
- Erfarenhet av pre-analytiska metoder, såsom till exempel cellsortering, snittning och DNA-extraktion.
- Erfarenhet av next-generation sequencing. 
- Erfarenhet av att utvärdera och optimera molekylära metoder. 
- Eftersom dokumentation mot Akademiska sjukhuset sker på svenska kräver tjänsten god förmåga att uttrycka sig på svenska i tal och skrift.
Arbetet ställer stora krav på noggrannhet, organisationsförmåga, initiativkraft, samarbetsförmåga och självständighet, så stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Önskvärt och/eller meriterande i övrigt
Erfarenhet av att arbeta i en klinisk laboratoriemiljö är meriterande. Tjänsten förutsätter en god förmåga att uttrycka sig på engelska i tal och skrift. Du kommer att vara del av ett team med många inblandade, vilket ställer höga krav på förmåga till samarbete och flexibilitet. 

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, 12 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Malin Melin, malin.melin@scilifelab.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 4 december 2024, UFV-PA 2024/3942.