Forskningsassistent

Forskningsassistent

Vill du arbeta med maskininlärning, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som forskningsassistent på Uppsala universitet.

Institutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden för det vi gör finns inom biologi, men vår forskning överlappar med andra områden som medicin, datavetenskap, matematik, kemi, ingenjörsvetenskap och fysik. Institutionen har över 200 anställda med cirka 60 doktorander. Läs gärna mer om organisationens arbete på https://icm.uu.se.

Arbetsuppgifter

Den sökande kommer att arbeta inom ett projekt som syftar till att klarlägga hur mutationer påverkar proteiners stabilitet, med särskilt fokus på sjukdomsassocierade mutationer. Arbetet innefattar metodutveckling i gränslandet mellan maskininlärning och fysikbaserade beräkningsmetoder. Arbetsuppgifterna innefattar bland annat: vetenskaplig programmering i Python, särskilt vidareutveckling av den interna koden QresFEP (https://github.com/qusers/qligfep); identifiering, insamling och kurering av mutationsdata för utvärdering och testning av metoden; storskaliga molekylärdynamiksimuleringar och fria energiberäkningar; samt analys av simuleringar, inklusive utveckling av djupinlärningsmodeller för att tolka och komplettera de fria energiberäkningarna.

Kvalifikationskrav

Den sökande ska ha en kandidatexamen i kemi och en masterexamen i läkemedelsutveckling eller motsvarande. Erfarenhet av molekylära simuleringstekniker såsom molekylärdynamik och fria energiberäkningar bör finnas dokumenterad med publikationer inom forskningsområdet. Sökande ska ha bakgrund inom (t.ex. genom specialiserade kurser eller undervisningserfarenhet) strukturell och/eller farmaceutisk bioinformatik, termodynamik och statistisk mekanik samt djupinlärning. Erfarenhet av vetenskaplig beräkningsmiljö, inklusive Unix-baserade system, användning av högpresterande beräkningsresurser, bash-/shellskript och vetenskaplig programmering i Python är ett krav. Den sökande ska ha mycket god förmåga att kommunicera på engelska i både tal och skrift, samt kunna arbeta självständigt såväl som ha god samarbetsförmåga. 

Önskvärt/meriterande i övrigt 

Undervisningserfarenhet, särskilt med fokus på handledning av studenters självständiga projekt eller forskningsförberedande moment, liksom erfarenhet med djupinlärningsmetoder inom biokemiska eller biofysikaliska tillämpningar, anses meriterande.

Om anställningen 

Anställningen är tidsbegränsad, 3,5 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde 2025-09-13 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala 

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Johan Åqvist (+46 18 471 41 09, johan.aqvist@icm.uu.se).

Välkommen med din ansökan senast den 28 augusti 2025, UFV-PA 2025/2437.