Doktorand i strukturbaserad läkemedelsdesign med fokus på maskininlärning

Vill du arbeta med läkemedelsdesign, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som doktorand på Uppsala universitet.

Institutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden för det vi gör finns inom biologi, men vår forskning överlappar med andra områden som medicin, datavetenskap, matematik, kemi, ingenjörsvetenskap och fysik. Institutionen har över 200 anställda med cirka 60 doktorander. Läs gärna mer om organisationens arbete på https://icm.uu.se.

Doktorandtjänsten kommer att vara placerad i Jens Carlssons forskargrupp på programmet för Beräkningsbiologi och Bioinformatik. Jens Carlssons forskning fokuserar på datormodellering av proteiners interaktioner med läkemedelsmolekyler. Gruppen använder modellering för att förstå hur proteiner fungerar på molekylär nivå och utvecklar metoder för att identifiera läkemedelskandidater, ofta i samarbete med experimentella forskargrupper. Jens Carlssons grupp är ett internationellt forskningsteam och är också en del av Science for Life Laboratory (http://www.scilifelab.se/). Mer information om gruppens forskning finns på dess hemsida (http://www.carlssonlab.org).

Arbetsuppgifter
Till Uppsala universitet söker vi en doktorand inom beräkningskemi. Som doktorand kommer du att arbeta med att utveckla och tillämpa beräkningsmetoder för att identifiera ligander (små molekyler och peptider) som binder till terapeutiskt relevanta receptorer, med visionen att accelerera utvecklingen av nya läkemedel. Arbetet omfattar flera utmaningar inom strukturbaserad läkemedelsdesign och inkluderar utforskning av nya tekniker baserade på artificiell intelligens. Du kommer att kombinera maskininlärning och virtuell screening för att söka efter ligander i kemiska bibliotek som innehåller flera miljarder molekyler. De metoder du utvecklar kommer att användas för att designa molekyler som binder till receptorer och enzymer. Molekylerna du identifierar kommer sedan att syntetiseras och testas i experiment av samarbetspartners.

Kvalifikationskrav
Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

• avlagt examen på avancerad nivå inom biologi, kemi, farmaci, fysik, datavetenskap eller annat ämne som arbetsgivaren bedömer som likvärdigt, eller
• fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
• på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Goda skriftliga och muntliga kunskaper i engelska är ett krav då arbetet sker i en internationell miljö.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Tidigare erfarenheter inom datormodellering av proteiner, datorbaserad läkemedelsdesign, molekylär dockning, kemoinformatik, maskininlärning och programmering är meriterande.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer.

Ansökan
Ansökan ska innehålla:

• Personligt brev där du beskriver dig själv, ditt erfarenheter av forskning och varför du är intresserad av tjänsten (max 1 sida).
• CV innehållande utbildning och andra meriter samt beskrivning av relevanta kunskaper utifrån kvalifikationskraven.
• Kopior på examensbevis och examensarbete.
• Kontaktinformation till två referenser.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde snarast eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Jens Carlsson, jens.carlsson@icm.uu.se, Tel: +46 (0)72 227 7976.

Välkommen med din ansökan senast 9 juli 2025, UFV-PA 2025/2029.