Postdoktor inom svampgenomik

Postdoktor inom svampgenomik

Vill du arbeta med systematisk biologi, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som Postdoktor på Uppsala universitet.

Vid institutionen för organismbiologi bedriver vi undervisning och forskning  om evolution, utveckling och funktion på organismnivå. Vi studerar också de djupaste förgreningarna i livets träd  med hjälp av bioinformatik och experimentella molekylära tekniker. Forskning om hur kemikalier av antropogent ursprung interagerar  med cellfunktioner och ger upphov till långvariga hälsoeffekter på människor och djur utförs också. För mer information se www.iob.uu.se.

Nu söker vi en postdoktor till Aaron Vogans grupp. Gruppen fokuserar på att förstå utvecklingen av genom och den genetiska grunden för anpassning i svamp. Vi upptäckte nyligen att många svampar har massiva mobila genetisk element, kallade Starships, som mobiliserar en stor mångfald av svampgener. Vi har nu kunnat tyda hur Starships rör sig mellan genom. Huvudmålet för tjänsten är att i en labbmiljö visa den horisontella överföringen av starships mellan olika svampar. Detta kommer att göras med hjälp av genetiskt modifierade modellstammar så att lyckade överföringar kan screenas med stort arbetsflöde på selektiv media. 

Arbetsuppgifter

Du kommer huvudsakligen arbeta i våtlaboratoriet. Fokus kommer att ligga på transformationer av svampen Aspergillus fumigatus och potentiellt relaterade arter. Detta kommer även att inkludera vektorkonstruktion med hjälp av jäst- och/eller bakterietransformationer. Metoder kan också innefatta CRISPR/Cas9. Du förväntas också analysera den data som genereras, inklusive en viss del av bioinformatiskt arbete. Sökanden förväntas kommunicera sina fynd både vid internationella konferenser och genom att skriva vetenskapliga artiklar för publicering.

Den planerade metodiken kommer att innefatta etablerade genetiska transformationstekniker, såsom PCR, primerdesign, bakteriell kloning, jästkloning och transformationer av filamentösa svampar. Dessutom kommer svampodling att utföras med olika medier och odlingsförhållanden.

Kvalifikationskrav

Doktorsexamen i molekylär biologi/ evolutionär biologi eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen i biologi. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.

Förmåga att presentera data och utföra statistiska analyser är ett krav. Personliga egenskaper såsom organisationsförmåga, styrka i problemlösning, kommunikation och samarbete är önskvärda. Sökanden ska ha dokumenterad erfarenhet och skicklighet i både muntlig och skriftlig presentation på engelska. Mikrobiell odling av svampar och svamptranformationer är meriterande. Erfarenhet av Aspergillus fumigatus är speciellt önskvärt. 

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad i 2 år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 2025-01-06 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Aaron Vogan, aaron.vogan@ebc.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 6 december 2024, UFV-PA 2024/377.