Bioinformatiker, transkriptomanalys - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS; https://nbis.se) är en stor och snabbt växande nationell infrastruktur som främjar forskning inom livsvetenskaperna i Sverige genom att tillhandahålla support, infrastruktur och avancerad utbildning inom bioinformatikområdet. NBIS utgör bioinformatikplattformen på SciLifeLab (https://www.scilifelab.se), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade storskaliga tekniker och kunnande inom biovetenskaperna, och är också den svenska noden i den europeiska infrastrukturen ELIXIR för biologisk information.

Vi utökar nu vår kapacitet för support inom vårt team för cell- och molekylärbiologi. Teamet arbetar med alla aspekter av bioinformatiska analyser för att få vidare förståelse av hur molekylära komponenter påverkar funktionen hos celler och organismer. De personer som anställs kommer att integreras i ett bioinformatikteam i en spännande forskningsmiljö med många möjligheter till utveckling av nya och existerande färdigheter för att hålla sig à jour med nya sekvenserings-teknologier och andra bioinformatiska utmaningar när de uppstår.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden
Vi letar efter en expert som primärt kommer att arbeta med bioinformatikanalys av transkriptomik-data, men också med andra typer av bioinformatiska analyser. Arbetet innefattar att stödja svenska forskare inom detta område, och finansieras delvis med användaravgifter från forskargrupperna. Projekten man deltar i kommer skifta i komplexitet och längd och data kommer från olika organismer med varierande frågeställningar.

Ansvarsområden inkluderar att planera, initiera, utföra och rapportera analyser samt kommunicera med forskargrupper samt hålla sig uppdaterad inom fältet och att ibland engageras i avancerad utbildning av svenska forskare inom bioinformatik. Regelbundna interna möten och internutbildning, samt tid för utveckling av egna färdigheter och lärande från en diversifierad grupp av NBIS-kollegor ger förutsättningar för NBIS-bioinformatikerna att utföra högklassiga bioinformatikanalyser.

Arbetet kommer att innebära ett visst mått av resande, eftersom kunskapsutbyte är en viktig del av vår verksamhet för att bibehålla spjutspetsexpertis för analys av befintliga och nya datatyper.

Kvalifikationskrav
De framgångsrika sökande behöver uppfylla följande krav:

•  PhD inom något av följande områden: bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller ett närgränsande fält som arbetsgivaren bedömer relevant för tjänsten.
• Postdoktoral erfarenhet
• Erfarenhet av arbete (minst 3 år) med avancerade bioinformatikanalyser av transkriptomik data från bulk, single cell och spatiala högkapacitetsmetoder.
• Erfarenhet av arbete (minst 3 år) med immunologiska sjukdomar
• Förmåga att, på internationellt konkurrenskraftig nivå, självständigt driva supportprojekt och utföra dataanalys relaterande till omik-data
• God förmåga i ett skriptspråk såsom R eller Python, samt att arbeta effektivt i Linux kommandoradsmiljö och på storskaliga datorkluster.
• Mycket god förmåga att kommunicera på engelska, både i tal och skrift, samt förmåga att kommunicera med forskare med olika bakgrunder
• Förmåga att samarbeta och arbeta i en serviceintriktad organisation
• Vilja att lära sig nya metoder och ha en förmåga att utveckla nya färdigheter
• Förmåga att driva projekt självständigt. ”Reproducerbar forskning” och ”FAIR data” är centrala koncept för oss, och expertis i utveckling av reproducerbar kod genom användande av koddelningsplattformar, arbetsflödesspråk, och container- lösningar är en stark merit. 

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är 100 %. Tillträde snarast eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Såhär söker du
Ansökan ska innehålla CV och personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan bör innehålla examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).

Upplysningar om anställningen lämnas av: Anna Johansson, anna.johansson@icm.uu.se, 018-471 4226

Välkommen med din ansökan senast den 18 oktober 2023, UFV-PA 2023/3622.