Forskningsassistent - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som alla fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden till vad vi gör ligger i biologi, men vår forskning överlappar med andra områden såsom medicin, datavetenskap, matematik, kemi, ingenjörsvetenskaper och fysik. Institutionen har över 200 anställda med runt 60 doktorander. Läs gärna mer om verksamhetens arbete på https://icm.uu.se. Den här befattningen kommer att vara placerad i Bengt Perssons forskargrupp inom programmet för Beräkningsbiologi & Bioinformatik.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Arbetsuppgifter
Forskningsprojektet fokuserar på analys av genuttryck i hjärtvävnad vid olika typer av hjärtsvikt. Bioinformatisk analys av differentiellt uttryckta gener inkluderande funktionell karakterisering och reglering av metaboliska nätverk. Härutöver kommer vi att analysera biomarkörer och proteomikdata. I forskargruppen studerar vi också nya metoder för bioinformatisk karakterisering och subindelning av stora proteinfamiljer.

Kvalifikationskrav

• Civilingenjör i bioinformatik eller annat område som arbetsgivaren bedömer som likvärdigt.
• Gedigen erfarenhet (minst 3 år) av att arbeta med NGS-data, RNAseq-data, differentiell expression, nätverksanalyser (t.ex. IPA, WGCNA) och andra bioinformatiska och biostatistiska metoder.
• Erfarenhet av att hantera patientdata och bedriva samarbete med kliniska forskare.
• God vana av att arbeta i terminalbaserad Linux-miljö (*sh) och förmåga att utveckla skript inom Python eller Perl är nödvändig. God vana av R och Bioconductor är också nödvändig.
• Erfarenhet av storskaliga datorberäkningar, t.ex. användning av SNIC kluster.

Den sökande skall ha mycket god förmåga att arbeta självständigt såväl som i grupp. Den sökande bör även ha goda skriftliga och muntliga kunskaper i engelska, då arbetet sker i en internationell miljö. Särskild vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Önskvärt/meriterande i övrigt

• Erfarenhet av samarbete med företag
• Erfarenhet av hidden-Markov-modeller

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde snarast eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Bengt Persson, bengt.persson@icm.uu.se, 018-471 4422

Välkommen med din ansökan senast den 6 februari 2023, UFV-PA 2023/198.