Forskningsassistent

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi

Arbetsbeskrivning:
Tjänsten fokuserar på att utnyttja zebrafisk som modellorganism för att utveckla och
optimera genetiska verktyg genom en riktad evolutionär pipeline, med betydande terapeutiska
och industriella tillämpningar.
Nyckelansvar inkluderar:
-Analysera och tolka storskaliga omikdataset (t.ex. kromatintillgänglighet, transkriptomik, proteomik) med hjälp av statistiska och beräkningsmetoder.
-Utföra bioinformatiska analyser såsom differentiell expression, klusterbildning, klassificering och datavisualisering med hjälp av relevanta bioinformatiska verktyg.
-Optimera och designa genetiska sekvenser för experimentella tillämpningar, inklusive
kodonoptimering och strukturell prediktion.
-Samarbeta med forskare i våtlaboratorier för att integrera beräkningsanalys med experimentella arbetsflöden. - Dokumentera arbetsflöden, skript och resultat för att säkerställa reproducerbarhet och underlätta samarbete.

Kvalifikationer:
- Masterexamen i bioinformatik, systembiologi, molekylär bioteknik eller motsvarande erfarenhet inom beräkningsbiologi.
- Starka färdigheter inom programmering och statistisk dataanalys.
- Dokumenterad erfarenhet av omics-dataanalys och/eller sekvensoptimering.
- Förmåga att arbeta självständigt med ett samarbetsvilligt och kommunikativt tillvägagångssätt.
- God kommunikationsförmåga och flytande engelska, både muntligt och skriftligt.

Meriterande:
- Erfarenhet av proteinmodellering och prediktionsverktyg.
- Bekantskap med maskininlärningsmetoder för biologiska data.
- Förståelse för molekylärbiologiska tekniker för att bättre integrera beräknings- och experimentella data.
- Erfarenhet av nästa generations sekvenseringsdatabehandling och sammansättning.
- Positiv och proaktiv personlighet, med en vilja att lära sig och bidra till en dynamisk forskningsmiljö.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, 12 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Thomas Juan, thomas.juan@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 23 september 2025, UFV-PA 2025/2616.