Doktorand i Patrick Mickes forskargrupp - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, patologi, neuroonkologi, vaskulärbiologi, strålningsvetenskap samt molekylära verktyg. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar och masterprogram inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 450 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 500, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.igp.uu.se.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Arbetsuppgifter
En doktorandplats utlyses för motiverade individer med intresse i molekylär tumörbiologi, tumörimmunologi och tumörpatologi vid Professor MD Patrick Mickes laboratorium vid Uppsala Universitet, Institutionen för Immunologi, Genetik och Patologi. Doktoranden kommer att genomföra analyser som syftar till att identifiera nya prognostiska såväl som prediktiva biomarkörer för NSCLC-patienter. De största fokusområdena kommer att ligga på att studera tumör-immuncell/tumör-stroma interaktioner under progression av NSCLC samt under resistensutveckling mot checkpoint-inhibitorer. De analytiska metoderna är baserade på avancerade RNA-sekvenseringsanalyser inklusive TCR- och BCR-sekvensering som kommer att utföras regelbundet. Det transkriptomiska datat kommer att kompletteras med in situ-tekniker såsom multiplex immunfluorescens (Vectra Polaris-systemet), RNA-scope och in situ-sekvensering för en mer omfattande signaleringsprofilering av den tumörimmuna mikromiljön. En central del av doktorandens studier kommer att bestå av att lära sig hur man framställer dessa data för att svara på forskningsfrågor i en bredare kontext. Ytterligare uppgifter inkluderar digitala bildanalyser.

Doktorandens främsta förpliktelse är att ägna sig åt sina forskningsprojekt och kurser på forskarnivå. Intresse för att lära sig och utvecklas inom bioinformatiska tillämpningar är nödvändigt för att kunna utföra dessa projekt. Doktoranden förväntas engagera sig aktivt i gruppens forskning och bidra till en fungerande laboratoriemiljö. Stöd och uppmuntran för deltagande i alla relevanta aktiviteter organiserade av forskningsnätverket kommer att ges. Vidare information om gruppens forskningsområde ges på https://igp.uu.se/research/clinical_experimental_pathology/patrick-micke/.

Doktorandanställningen avser egna studier på heltid under maximalt 4 år. Innehavare av doktorandanställning ska främst ägna sig åt egen utbildning på forskarnivå men övrigt arbete såsom utbildning av studenter och administrativt arbete kan ingå med högst 20 procent av anställningen. Anställningen kommer att förlängas med undervisningstiden för att möjliggöra fyra år av heltidsstudier på forskarnivå.

Kvalifikationskrav
Sökande ska ha examen på masternivå/läkarexamen eller motsvarande inom relevant område (t.ex. molekylärbiologi, tumörbiologi, tumörimmunologi, patologi eller bioinformatik). Erfarenhet av arbete inom bioinformatik, speciellt RNA-sekvensering, samt erfarenhet av programmering och/eller digital bildanalys är mycket meriterande. Tidigare erfarenhet av histologiska vävnadsanalyser speciellt av in situ vävnadsprofilering är meriterande. Utmärkta färdigheter i talad och skriven engelska erfordras. Sökande måste vara högmotiverad, lagorienterad och öppensinnad.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Sökande med en entreprenörsanda välkomnas.

För anställning som doktorand krävs att innehavaren är antagen eller kommer att antas till utbildning på forskarnivå där graden av förmåga att tillgodogöra sig utbildning på forskarnivå är avgörande. Information om forskarutbildningen, ansökningsförfarande och regler för antagning finns tillgängligt via https://mp.uu.se/sv/web/info/forska/forskarutbildning/medicin-och-farmaci/.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer.

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde 2022-09-01 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Carina Strell, Carina.strell@igp.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 18 juli 2022, UFV-PA 2022/2634.