Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper

Institutionen för medicinska vetenskaper, Uppsala universitet, söker en teknisk chef till SNP&SEQ-plattformen. 

Som en del av den nationella infrastrukturen för genomik (National Genomics Infrastructure, NGI) vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab, www.scilifelab.se), erbjuder SNP&SEQ-teknologiplattformen SNP-genotypning och nästa  generationens sekvenseringsteknologi (Next Generation Sequencing, NGS) som service åt forskare i Sverige och andra länder (www.genotyping.se).

 Arbetsuppgifter:

  • Att leda bioinformatiskt och mjukvaruinriktat systemutvecklingsarbete vid SNP&SEQ-plattformen
  • Att ha ett övergripande ansvar för bioinformatikinfrastrukturen vid plattformen
  • Att utföra bioinformatiskt utvecklingsarbete och systemutveckling
  • Att ge arbetsuppgifter till bioinformatiker och systemutvecklare som deltar i mjukvaruutvecklingsprojekt.
  • Att handha kontakter med plattformens uppdragsgivare rörande bioinformatiska frågeställningar.
  • Att göra prioritetsbedömningar i det dagliga arbetet i utvecklingsprojekt
  • Att identifiera förbättringsåtgärder inom bionformatiken och IT-systemen vid plattformen
  • Att informera om plattformens verksamhet vid studiebesök eller seminarier.
  • Att upprätthålla en specialistkompetens i relevanta teknologier och applikationer. Att planera och genomföra kurser inom bioinformatik
  • Att delta i att skriva vetenskapliga publikationer och ansökningar om forskningsanslag 

Kvalifikationskrav:

  • Civilingenjör- eller masterexamen (eller motsvarande) i molekylär bioteknologi eller bioinformatik
  • Doktorsexamen i medicinska vetenskaper med inriktning mot medicinsk bioinformatik eller molekylär genetik, eller där med jämförbart område
  • Dokumenterad flerårig erfarenhet av bioinformatiskt och mjukvaruinriktat utvecklingsarbete
  • Erfarenhet av att leda bioinformatiskt och mjukvaruinriktat utvecklingsarbete
  • Flerårig erfarenhet av arbete med Stackstorm eller liknande automatiseringsplattform
  • Flerårig erfarenhet av arbete med NGS data 

Önskvärt/meriterande i övrigt:

  • Erfarenhet av arbete i Open Source projekt
  • Erfarenhet av arbete med högprestandaberäkningssystem
  • Erfarenhet av arbete med containerlösningar, t.ex. Docker, Singularity
  • Erfarenhet av arbete i molnmiljöer  

Lön: individuell lönesättning tillämpas. 

Tillträde: Snarast. 

Anställningsform: Tillsvidareanställning, provanställning kan komma att tillämpas. 

Anställningens omfattning: 100%

Upplysningar om anställningen lämnas av: Pontus Larsson, Pontus.larsson@medsci.uu.se eller Ann-Christine Syvänen, Ann-Christine.Syvanen@medsci.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 23 december 2018, UFV-PA 2018/4285.

Anställningsform Tillsvidareanställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Snarast
Löneform individuell lönesättning tillämpas
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Uppsala
Län Uppsala län
Land Sverige
Referensnummer UFV-PA 2018/4285
Facklig företrädare
  • Ellena Papaioannou, Seko, 018-471 3315
  • Suzanne Borén Andersson, TCO/ST, 018-471 6251
  • Per Sundman, Saco-rådet, 018-471 1485
Publicerat 2018-12-11
Sista ansökningsdag 2018-12-23

Tillbaka till lediga jobb