Forskare inom Epigenetisk och multi-OMICs dataanalys

Institutionen för organismbiologi vid Uppsala universitet utforskar evolution, systematik, utveckling och funktion på organismnivå. Fysiologi och miljötoxikologi-programmet är en växande, dynamisk forskningsmiljö där experimentella modeller och molekylära verktyg används för att studera och förstå cellulära och molekylära mekanismer hos djur och växter som ligger till grund för hela organismens fysiologi, utveckling och respons på miljön.

I denna inspirerande miljö undersöker EpiTox-Gruppen hur miljökemikalier påverkar hjärnutvecklingen och -funktionen över en eller fler generationer med hjälp av olika cellmodeller och OMICs tekniker. Forskningen sträcker sig från undersökningar av grundläggande molekylära mekanismer bakom kemikaliers effekter på hjärnan till utveckling av nya metoder för kemikalietestning. Mer information finns på vår webplats.

Arbetsuppgifter
Du kommer att driva bioinformatiska och multi-OMICs analyser i olika projekt: EpiTag-projektet som syftar till att kartlägga epigenetiska mekanismer som leder till ”transgenerational epigenetic inheritance” av beteendeförändringar inducerade av kemisk exponering hos zebrafisk; ENDpoiNTs och PARC-projekten, stora EU projekt som syftar till att utveckla nya metoder för att identifiera kemikalier som inducerar neuroutvecklingstoxicitet; och ett projekt kring epigenetiska förändringar i könsdysfori. Projekten involverar olika epigenetiska dataset framtagna med Oxford Nanopore Sequencing, ”reduced-representation bisulfite sequencing” (RRBS) och Illumina EPIC bead array. Dessutom ska dessa dataset integreras med andra OMICs (transkriptomik, metabolomik) data samt beteendedata.

Du förväntas planera, utföra, analysera och tolka ditt arbete självständigt, skriva vetenskapliga publikationer och bidra till projektrapporter, delta i internationella möten och konferenser, handleda masterstudenter samt engagera dig i den vetenskapliga och sociala arbetsmiljön vid programmet och institutionen.

Kvalifikationskrav
Doktorexamen i bioinformatik, beräkningsbiologi eller motsvarande som av arbetsgivaren bedöms likvärdig. Mycket goda erfarenheter av data analys av epigenetiska dataset framtagen med olika metoder, särskilt Oxford Nanopore sekvensering, är ett krav. Den sökande ska även ha erfarenhet av multi-OMICs dataanalyser och olika biostatistiska modeller samt att skriva vetenskapliga artiklar. Vidare ska den sökande ha mycket god förmåga att uttrycka sig på engelska, i såväl tal som skrift. Vid rekryteringen fäster vi särskild vikt vid personliga egenskaper såsom kandidatens förmåga till samarbete, kommunikation i tal och skrift, initiativförmåga och självständighet.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad 12 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde 1 november 2025 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Joëlle Rüegg, +46 18- 4716164, joelle.ruegg@ebc.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 29 september 2025, UFV-PA 2025/2791.