Postdoktor

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi

Vi söker en driven och motiverad postdoktor för arbete med forskning och utveckling (R&D) vid Uppsala Genome Center (UGC), en enhet inom National Genomics Infrastructure (NGI) vid SciLifeLab i Uppsala. Vi erbjuder storskalig long-read-sekvensering (NGS) till användare inom svensk akademi, industri och till internationella användare. Verksamheten består av ett team av projektkoordinatorer, forskningsingenjörer och bioinformatiker. Årligen analyserar vi mer än 1500 prover och genererar över 20 Terabaser data åt våra användare. Mer information om verksamhet hos Uppsala Genome Center finns på: https://www.uu.se/en/research/uppsala-genome-centre.

Arbetsuppgifter
Dina ansvarsområden kommer att omfatta men inte vara begränsade till:
• Att driva R&D-projekt relaterade till verksamheten vid Uppsala Genome Center
• Utveckling och implementering av nya protokoll och applikationer
• Bioinformatiska analyser av longread-sekvensdata
• Utveckla och implementera dataverktyg och arbetsflöden för bioinformatiska analyser
• Presentera data från utvecklingsprojekt vid interna och externa möten och konferenser
• Sammanställa resultat och publicera vetenskapliga artiklar

Kvalifikationskrav
Doktorsexamen inom bioinformatik, bioteknik, molekylärbiologi, genetik eller relaterat område eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.
• Dokumenterad erfarenhet av bioinformatiska analyser av sekvensdata
• Erfarenhet av att hantera, sammanställa och visualisera data
• Goda kunskaper i bioinformatik inom genomik och storskalig sekvensering (NGS).
• Dokumenterad erfarenhet av analys av sekvensdata med relevanta programmeringsspråk (t ex Python, R).
• Kunskap om att arbeta i Linux-miljö och i HPC-system.
• Dokumenterad erfarenhet av att sammanställa och publicera vetenskapliga artiklar inom närliggande ämnesområde
• Förmåga att hantera och prioritera uppgifter effektivt.
• Förmåga att snabbt lära nya färdigheter.
• Förmåga att självständigt identifiera och lösa problem under dataanalys.
• Mycket goda kunskaper i svenska och engelska, både muntligt och skriftligt.

Vi söker en person som är utåtriktad, proaktiv, ansvarsfull, noggrann och bekväm med att arbeta både självständigt och i team. Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper såsom en positiv attityd till serviceinriktat arbete och god samarbetsförmåga.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Utöver de kvalifikationer som anges ovan uppskattar vi tidigare erfarenhet inom ett eller flera av följande områden:
• Erfarenhet av metodutveckling och utveckling av analysverktyg
• Erfarenhet av molekylärbiologiskt arbete i laboratoriemiljö, gärna NGS-metoder.
• God förståelse för hur preanalytiska och laboratoriemetoder kan påverka datakvaliteten.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad i 3 år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Susanne Hellstedt Kerje, susanne.kerje@igp.uu.se, Lars Feuk, lars.feuk@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 15 augusti 2025, UFV-PA 2025/2151.