Doktorand i populationsgenomik

Vid institutionen för organismbiologi bedriver vi undervisning och forskning om evolution, utveckling och funktion på organismnivå. Vi studerar också de djupaste förgreningarna i livets träd med hjälp av bioinformatik och experimentella molekylära tekniker. Forskning om hur kemikalier av antropogent ursprung interagerar med cellfunktioner och ger upphov till långvariga hälsoeffekter på människor och djur utförs också. För mer information se www.iob.uu.se.

De senaste årens utveckling inom populationsgenetiska metoder, statistiska metoder och molekylärgenetiska verktyg ger oss idag unika möjligheter att förstå arters demografiska historia. Människan används ofta som modellorganism för att undersöka nya populationsgenetiska metoder för att undersöka demografisk historia. Projektet fokuserar på att undersöka populationsstruktur hos människan över tid. Dessa processer undersöks med hjälp av storskaligt populationsgenetiskt data från nu levande och förhistoriska människor. Den sökande kommer att arbeta i professor Mattias Jakobssons och Maximilian Larenas forskargrupper. Forskarprogrammet ”Människans evolution” består av ett internationellt team av forskare (seniora forskare, postdoktorer, doktorander och forskningsingenjörer) och deltagarna har ett brett intresse för populationsgenetik och människans evolutionära historia. Forskningen kombinerar populationsgenetiska modeller och empiriska data för att förstå komplexa mönster av genetisk variation hos människan. Forskarprogrammet fokuserar på att a) förstå människans demografiska och evolutionära historia med hjälp av genetisk information från både nu levande och förhistoriska individer, att b) utveckla statistiska metoder för att analysera storskaliga genomiska data och att c) söka efter gener som förändrats pga selektion under människans utveckling. Forskningen finansieras bla av Vetenskapsrådet och Knut och Alice Wallenbergs stiftelse. Forskarprogrammet är multidisciplinärt med kompetens inom beräkningsbiologi, populationsgenomik och "ancient DNA", och programmet är associerat med VRs excellence centrum för människans förhistoria (https://centerforthehumanpast.se/). Forskningsmiljön är internationell med engelska som arbetsspråk. För mer information och aktuell forskning, se forskargruppernas webbsidor: http://jakobssonlab.iob.uu.se/ och https://www.larenalab.com

Arbetsuppgifter
Doktorandprojektet kommer att fokusera på populationsgenomiska studier av nu-levande och förhistoriska människor i Asien-Stillahavsregionen. Arbetsuppgifterna inkluderar bearbetning av prover från mänskliga kvarlevor för att extrahera ”ancient” DNA samt analys av storskaliga genomiska dataset från både nu-levande och förhistoriska individer för att dra slutsatser om demografisk historia, migration och adaptation. Projektet kommer att fokusera på människans evolutionära historia i Sydostasien och Oceanien. De specifika doktorandprojekten kommer att utformas tillsammans med den utvalda kandidaten.

Kvalifikationskrav
Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

• Avlagt examen på avancerad nivå inom molekylärbiologi/genetik, eller annan inriktning som arbetsgivaren bedömer som likvärdig eller
• Fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
• På något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Vi söker en person med goda kunskaper och erfarenhet i bioinformatikanalys och goda kunskaper av laboratoriearbete, med erfarenhet av arbete med palaeogenomik. Stor vikt att läggas vid personliga egenskaper såsom:

• God analytisk förmåga, god samarbets- och kommunikations-förmåga.
• Förmåga att arbeta självständigt och ta egna initiativ.
• God planerings- och organisationsförmåga, ansvarstagande.
• God förmåga att uttrycka sig väl i tal och skrift på engelska.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av att arbeta i renrumsförhållanden i ancient DNA-labb. Erfarenhet av hantering och bearbetning av prover för ancient DNA-forskning. Erfarenhet från storskaliga populationsgenomiska analyser är meriterande. Goda kunskaper om mänskliga populationers förhistoria i Asien och Stilla havet inklusive Sydostasien och Oceanien. Träning i bioinformatik, genomik, molekylär genetik är meriterande.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer.

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska innehålla 1) ett brev som beskriver dig själv, dina forskningsintressen och varför du vill doktorera, 2) en kort beskrivning av din utbildning, särskilt i populationsgenetik/genomik, statistik, bioinformatik och andra relaterade områden, 3) en CV, 4) en kopia av din masterexamen, 5) namn och kontaktuppgifter (adress, epostadress och telefonnummer) till minst två referenspersoner, 6) relevanta publikationer (inklusive masteruppsats). Ansökan bör skrivas på engelska.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Mattias Jakobsson, +46-18-471 6449, mattias.jakobsson@ebc.uu.se och Dr. Maximilian Larena, +46 18-471 2624, maximilian.larena@ebc.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 28 november 2024, UFV-PA 2024/3920.