Forskningsingenjör

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 500 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi

Arbetsuppgifter
Vi söker en medarbetare till Uppsala Genome Center som ska delta i det laborativa arbetet med  DNA/RNA-”long-read”-sekvenseringsmetoder. Detta innefattar s.k. Next Generation DNA-sekvensering (NGS) med teknologi från PacBio (Revio). Arbetet innefattar ankomstkontroll och provberedning av DNA- och RNAprover för sekvensanalys. Provberedning sker i huvudsak manuellt men i vissa fall automatiserat med datorstyrda pipetteringsrobotar. Förutom sekvensering kommer extraktion av ultrahögmolekylärt DNA och i viss mån även RNA extraktioner från olika typer av biologiskt material samt beredning av prover för kromatininteraktionsanalys (HiC-analys) att ingå i arbetsuppgifterna. Arbetet innefattar också hantering, underhåll och vid behov felsökning av de instrument som används i verksamheten. Vissa datorrelaterade uppgifter ingår i arbetet, såsom användning av MiniLims (BioTeam) för registrering av projekt, prover och arbetsflöden. Utveckling av funktioner i Microsoft Excel för att underlätta dokumentation av provflöde, provhantering och sammanställningar av data. Analys och bearbetning av NGS-data kommer ev. också att ingå i arbetsuppgifterna.

Kvalifikationskrav
Högskoleutbildning inom biologi, molekylärbiologi, bioteknik eller motsvarande. Erfarenhet av arbete med provberedning och instrument för DNA/RNA-sekvensbestämning med hjälp av NGS teknologier, specifikt PacBio. Erfarenhet av DNA extraktioner från utmanande biologiska material samt beredning av prover för kromatininteraktionsanalys (HiC-analys). Goda kunskaper i användning av Microsoft Office och erfarenhet av UNIX-baserade program. Arbetet innebär att kontinuerligt lära sig hantera nya instrument samt nya metoder och protokoll för provberedning. Ett krav är förmåga att med eget initiativ och självständighet utföra arbetet enligt uppdrag samt att ta ansvar för utfört arbete gentemot uppdragsgivare. Den sökanden ska ha dokumenterad erfarenhet av självständigt arbete. God förmåga att kommunicera på svenska och engelska i tal och skrift är ett krav då återkommande kontakt och kommunikation med de forskare som vi utför uppdrag åt är en viktig del av verksamheten. 

Önskvärt och/eller meriterande i övrigt
Vi söker en medarbetare som är utåtriktad, resultatorienterad, har god samarbetsförmåga och som trivs att arbeta i grupp. Sökande behöver ha god arbetsdiciplin och noggrannhet. Vi ser gärna sökande med erfarenhet från arbete i liknande form av uppdragsverksamhet. Erfarenhet av arbete inom ackrediterad verksamhet är meriterande. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet. Arbetet kan periodvis medföra hög arbetsbelastning. 

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Susanne Hellstedt Kerje, susanne.kerje@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 19 juni 2024, UFV-PA 2024/1863.