Forskningsingenjör inom klinisk och experimentell patologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, patologi, neuroonkologi, vaskulärbiologi, strålningsvetenskap samt molekylära verktyg. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar och masterprogram inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 450 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 500, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.igp.uu.se

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Arbetsuppgifter
Cecilia Lindskog Bergströms forskargrupp med koppling till Human Protein Atlas-projektet söker en motiverade forskningsingenjör att delta i projekt inom spatiell proteomik. Med hjälp av en datadriven strategi och ett systembiologiskt tillvägagångssätt syftar projekten till att generera en högupplöst karta av humana organ. Projekten har som målsättning att vidareutveckla och använda olika tekniker för singel cell-detektion av protein och mRNA-uttryck och integrera resultaten från dessa analyser med stora publikt tillgängliga dataset på såväl protein och mRNA-nivå. En stor tonvikt ligger på dataanalys med hjälp av bioinformatik och vidareutveckling av metoder för automatiserad bildanalys eller maskininlärning. Kandidaten kommer att arbeta i en multidisciplinär miljö tillsammans med såväl biologer som bioinformatiker och kommer även att ha en nära kontakt med Human Protein Atlas-projektets verksamhet vid Scilifelab/KTH. Arbetet förväntas bidra till flera olika pågående forskningsprojekt, men också till det rutinmässiga arbetsflödet för generering av data till den publikt tillgängliga databasen www.proteinatlas.org. Det finns ett stort utrymme för kreativitet och egna idéer.  

Kvalifikationskrav
Masterexamen i bioteknologi, bioinformatik eller närliggande område. En gedigen kunskap inom dataanalys är ett krav. Vi söker en kreativ kandidat med ett brett intresse för tekniker med koppling till proteomik och transkriptomik. Goda kunskaper i engelska i såväl tal som skrift är ett krav. Kandidaten förväntas ha god ansvarsförmåga och kunna arbeta självständigt i en omväxlande och multidisciplinär miljö med tidvis högt arbetstempo.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av programmering i R eller metoder för automatiserad bildanalys. Tidigare kunskap inom proteomik, transkriptomik eller bildanalys. Stor vikt läggs vid personliga egenskaper, såsom motivation, positiv inställning, kommunikations- och samarbetsförmåga.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, 12 månader. Omfattningen är 100 %. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Cecilia Lindskog Bergström, 018-471 50 32, cecilia.lindskog@igp.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 9 mars 2022, UFV-PA 2022/573.